应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 【求助/交流】怎样从一段序列中查找基因结构
131/2返回列表12下一页
查看: 2617  |  回复: 12
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

ahui1883

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】怎样从一段序列中查找基因结构 已有8人参与

最近测序获得一段序列，想知道其中是不是含有编码基因的序列，还有就是编码什么基因，这个应该怎么查找啊。请各位大侠帮忙，不胜感激啊。
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
海阔凭鱼跃，天高任鸟飞。
1楼 2010-06-25 10:01:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ilxly

木虫 (小有名气)
★
ahui1883(金币+1):谢谢参与
ncbi上的cds一般就是该基因的编码序列
赞一下(1人) 回复此楼
2楼2010-06-25 10:12:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ahui1883

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by ilxly at 2010-06-25 10:12:08:
ncbi上的cds一般就是该基因的编码序列

但是我这个序列是一段随即的，我不确定它可以不可以编码基因啊。那怎么办？
赞一下 回复此楼
海阔凭鱼跃，天高任鸟飞。
3楼2010-06-25 10:13:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jiaminl

铁杆木虫 (知名作家)
★
ahui1883(金币+1):谢谢参与
友情支持
回复此楼
Nevergiveup!
4楼2010-06-25 16:25:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liyong1981

金虫 (正式写手)
★
ahui1883(金币+1):谢谢参与
先比对，查找相关信息~再设计引物，上下游扩增，对了，你的这段多长啊?说都没说清楚~真核还是原核，你说清楚~
赞一下(1人) 回复此楼
5楼2010-06-25 16:53:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xiaoxiao198439

银虫 (小有名气)
★ ★
ahui1883(金币+1):谢谢参与
lstt09nk(金币+1):欢迎多多交流~~ 2010-06-25 17:17:51
先扔到NCBI上做一下blast吧，看看是不是基因，跟哪些物种相似。编码就是能翻译蛋白的意思啊，因为有很多基因是不能翻译蛋白的，所以基因分成了编码基因和非编码基因，比如现在很热的miRNA就是非编码基因转录出来的。
赞一下(2人) 回复此楼
6楼2010-06-25 17:05:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zemin_fang

木虫 (正式写手)
★
ahui1883(金币+1):谢谢参与
ORF Finder
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gorf/gorf.html
赞一下(1人) 回复此楼
7楼2010-06-25 17:38:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xjxlqr2008

金虫 (初入文坛)
★
ahui1883(金币+1):谢谢参与
Each gene can function specific protein, and work independently,  gene ,no matter what it is has specific region called encoding sequence and non-encoding sequence,
encoding region will function corresponding protein, nonencoding region will be spliced during transciption stage, that's called RNA splicing.
赞一下(1人) 回复此楼
8楼2010-06-25 17:57:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ahui1883

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by liyong1981 at 2010-06-25 16:53:59:
先比对，查找相关信息~再设计引物，上下游扩增，对了，你的这段多长啊?说都没说清楚~真核还是原核，你说清楚~

我主要是做真核生物的多样性，目前找到同种不同菌株的一段相似序列，大约1100bp，它们在这段序列上的碱基差异可以找到，但是我想进一步知道这段序列是不是编码某个基因，这个怎么查啊。谢谢
赞一下 回复此楼
海阔凭鱼跃，天高任鸟飞。
9楼2010-07-02 20:18:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ahui1883

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by xiaoxiao198439 at 2010-06-25 17:05:02:
先扔到NCBI上做一下blast吧，看看是不是基因，跟哪些物种相似。编码就是能翻译蛋白的意思啊，因为有很多基因是不能翻译蛋白的，所以基因分成了编码基因和非编码基因，比如现在很热的miRNA就是非编码基因转录出来的。

我现在的序列1100bp左右，就是想知道它是不是基因，以及是编码基因还是非编码基因。这个应该怎么做啊？请高手指点
赞一下 回复此楼
海阔凭鱼跃，天高任鸟飞。
10楼2010-07-02 20:26:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 ahui1883 的主题更新
131/2返回列表12下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 293求调剂 +9 zjl的号 2026-03-16 14/700 2026-03-18 05:13 by qytt腾飞
[考研] 328求调剂，英语六级551，有科研经历 +3 生物工程调剂 2026-03-16 8/400 2026-03-17 19:03 by Wangjingyue
[考研] 301求调剂 +4 A_JiXing 2026-03-16 4/200 2026-03-17 17:32 by ruiyingmiao
[考研] 326求调剂 +5 上岸的小葡 2026-03-15 6/300 2026-03-17 17:26 by ruiyingmiao
[考研] 考研化学学硕调剂，一志愿985 +4 张vvvv 2026-03-15 6/300 2026-03-17 17:15 by ruiyingmiao
[考研] 085600材料与化工求调剂 +5 绪幸与子 2026-03-17 5/250 2026-03-17 16:40 by laoshidan
[考研] 286求调剂 +3 lemonzzn 2026-03-16 5/250 2026-03-16 20:43 by lemonzzn
[基金申请] 今年的国基金是打分制吗？ 50+3 zhanghaozhu 2026-03-14 3/150 2026-03-16 17:07 by 北京莱茵润色
[考研] 304求调剂 +5 素年祭语 2026-03-15 5/250 2026-03-16 17:00 by 我的船我的海
[考研] 材料与化工一志愿南昌大学327求调剂推荐 +7 Ncdx123456 2026-03-13 8/400 2026-03-16 12:15 by karry wen
[考研] 材料与化工 323 英一+数二+物化，一志愿：哈工大 本人本科双一流 +4 自由的_飞翔 2026-03-13 5/250 2026-03-14 19:39 by hmn_wj
[考研] 复试调剂 +4 z1z2z3879 2026-03-14 5/250 2026-03-14 16:30 by JourneyLucky
[考研] 材料080500调剂求收留 +3 一颗meteor 2026-03-13 3/150 2026-03-14 10:54 by peike
[考研] 336求调剂 +6 Iuruoh 2026-03-11 6/300 2026-03-13 22:06 by JourneyLucky
[考研] 290求调剂 +9 ADT 2026-03-11 9/450 2026-03-13 21:55 by JourneyLucky
[考研] 26调剂/材料科学与工程/总分295/求收留 +9 2026调剂侠 2026-03-12 9/450 2026-03-13 20:46 by 18595523086
[考研] 301求调剂 +6 Liyouyumairs 2026-03-11 6/300 2026-03-13 20:11 by JourneyLucky
[考研] 求调剂 +5 一定有学上- 2026-03-12 5/250 2026-03-13 18:31 by ms629
[考研] 290求调剂 +3 ADT 2026-03-13 3/150 2026-03-13 10:19 by peike
[考研] 283求调剂，材料、化工皆可 +8 苏打水7777 2026-03-11 10/500 2026-03-13 09:06 by Linda Hu
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭