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ahui1883

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】怎样从一段序列中查找基因结构 已有8人参与

最近测序获得一段序列,想知道其中是不是含有编码基因的序列,还有就是编码什么基因,这个应该怎么查找啊。请各位大侠帮忙,不胜感激啊。
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海阔凭鱼跃,天高任鸟飞。
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xiaoxiao198439

银虫 (小有名气)

★ ★
ahui1883(金币+1):谢谢参与
lstt09nk(金币+1):欢迎多多交流~~ 2010-06-25 17:17:51
先扔到NCBI上做一下blast吧,看看是不是基因,跟哪些物种相似。编码就是能翻译蛋白的意思啊,因为有很多基因是不能翻译蛋白的,所以基因分成了编码基因和非编码基因,比如现在很热的miRNA就是非编码基因转录出来的。
6楼2010-06-25 17:05:02
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ilxly

木虫 (小有名气)


ahui1883(金币+1):谢谢参与
ncbi上的cds一般就是该基因的编码序列
2楼2010-06-25 10:12:08
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ahui1883

金虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by ilxly at 2010-06-25 10:12:08:
ncbi上的cds一般就是该基因的编码序列

但是我这个序列是一段随即的,我不确定它可以不可以编码基因啊。那怎么办?
海阔凭鱼跃,天高任鸟飞。
3楼2010-06-25 10:13:48
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liyong1981

金虫 (正式写手)



ahui1883(金币+1):谢谢参与
先比对,查找相关信息~再设计引物,上下游扩增,对了,你的这段多长啊?说都没说清楚~真核还是原核,你说清楚~
5楼2010-06-25 16:53:59
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