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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 【求助/交流】怎样从一段序列中查找基因结构
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ahui1883

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】怎样从一段序列中查找基因结构 已有8人参与

最近测序获得一段序列，想知道其中是不是含有编码基因的序列，还有就是编码什么基因，这个应该怎么查找啊。请各位大侠帮忙，不胜感激啊。
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海阔凭鱼跃，天高任鸟飞。
1楼 2010-06-25 10:01:58
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xiaoxiao198439

银虫 (小有名气)
★ ★
ahui1883(金币+1):谢谢参与
lstt09nk(金币+1):欢迎多多交流~~ 2010-06-25 17:17:51
先扔到NCBI上做一下blast吧，看看是不是基因，跟哪些物种相似。编码就是能翻译蛋白的意思啊，因为有很多基因是不能翻译蛋白的，所以基因分成了编码基因和非编码基因，比如现在很热的miRNA就是非编码基因转录出来的。
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6楼2010-06-25 17:05:02
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ilxly

木虫 (小有名气)
★
ahui1883(金币+1):谢谢参与
ncbi上的cds一般就是该基因的编码序列
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2楼2010-06-25 10:12:08
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ahui1883

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by ilxly at 2010-06-25 10:12:08:
ncbi上的cds一般就是该基因的编码序列

但是我这个序列是一段随即的，我不确定它可以不可以编码基因啊。那怎么办？
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海阔凭鱼跃，天高任鸟飞。
3楼2010-06-25 10:13:48
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liyong1981

金虫 (正式写手)
★
ahui1883(金币+1):谢谢参与
先比对，查找相关信息~再设计引物，上下游扩增，对了，你的这段多长啊?说都没说清楚~真核还是原核，你说清楚~
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5楼2010-06-25 16:53:59
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