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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 怎样根据下列条件在NCBI上搜索到基因序列的全长
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戴维

新虫 (初入文坛)

[求助] 怎样根据下列条件在NCBI上搜索到基因序列的全长

我想搜索一个拟南芥基因PIN3的全长序列， 我已经在GENE里找到了这个基因的信息 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/843432
   也在http://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/NP_177250.1中找到了它的CDS序列NM_105762.2 。
     但我需要该基因的全长序列，有没有高手能通过这些条件来找到全长序列呢？
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1楼 2012-03-29 21:52:56
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xiaoyugutou

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【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nucc ... 054&to=26746395
这个就是
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2楼2012-03-29 22:22:16
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戴维

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by xiaoyugutou at 2012-03-29 22:22:16:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NC_003070.9?report=genbank&from=26743054&to=26746395
这个就是

这个以前我也找到过，大标题写着“Arabidopsis thaliana chromosome 1, complete sequence” 我以为是拟南芥一号染色体全长序列的意思，但是下面小字又有PIN3基因的内容，所以我没弄明白， 兄台能不能再给我介绍一点这个页面的知识，分就给你啦！
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3楼2012-03-30 10:02:33
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戴维

新虫 (初入文坛)
另外还有一个问题，大标题下面的编号是NC_003070.9，这个是一号染色体的全长序列编号， 我想要PIN3基因的全长序列编号，比如说，PIN3的CDS序列编号是NM_105762.2， 那我只要输入NM_105762.2就可以找到CDS序列的页面http://muchong.com/bbs/url.php?s=http%3A%2F%2Fwww.ncbi.nlm.nih.gov%2Fprotein%2FNP_177250.1

因为我要把序列储存为FASTA格式来进行BLAST比对， 储存名称也需要序列的编号的，那么PIN3全长序列的编号是多少呢？
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4楼2012-03-30 11:00:26
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xiaoyugutou

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【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
戴维: 金币+5, ★有帮助, 谢谢了 2012-03-31 10:04:48
他那个是提交的整个染色体的序列，但是你从那个蛋白链接过来的就只显示了蛋白基因的序列，你只要看下那个基因对应的序列范围就可以了，你把右手边的Change region shown的范围改了就可以显示整个染色体的序列了，关于你说的什么编号我没注意过
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5楼2012-03-30 19:57:11
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