24小时热门版块排行榜    

查看: 1723  |  回复: 4

kimiosn

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】怎样在一段序列中查找可能的测序引物? 已有3人参与

质粒是前人传下来的,不知道背景,我根据里面连的外源片段设计了引物,测了一下外源片段的5’上游序列,有400bp左右,但是我想知道这里面有什么可以用的通用测序引物,有什么方法可以查一下?

谢谢帮助

PS:其实可以根据测出来的自己设计一段测序引物,但引物合成也需要时间,我想找个通用的测序引物可以快一点儿
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ben1147

木虫 (正式写手)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
amisking(金币+1):欢迎发帖交流! 2010-07-01 21:14:37
blast一下不就知道是什么载体了么

NCBI上也有能去掉载体序列的程序
2楼2010-07-01 19:32:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

kimiosn

银虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by ben1147 at 2010-07-01 19:32:27:
blast一下不就知道是什么载体了么

NCBI上也有能去掉载体序列的程序

谢谢,具体在哪儿呢?本人小白
3楼2010-07-01 19:37:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ben1147

木虫 (正式写手)

★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
amisking:good! 2010-07-01 21:14:47
看天(金币+3):good! 2010-07-02 08:18:51
引用回帖:
Originally posted by kimiosn at 2010-07-01 19:37:03:


谢谢,具体在哪儿呢?本人小白

很多综合性的序列分析软件可以做到,比如DNAStar里面带的Seqman

NCBI的程序叫做VecScreen

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/VecScreen/VecScreen.html
4楼2010-07-01 20:52:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

段家一凡

木虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by kimiosn at 2010-07-01 19:37:03:


谢谢,具体在哪儿呢?本人小白

BLASTN即可知道你的是什么载体,测序时你就直接说用某某载体的通用引物就可以了。
5楼2010-07-02 01:10:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 kimiosn 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 化学调剂0703 +7 啊我我的 2026-03-11 7/350 2026-03-15 23:03 by 凌千颂111
[考研] 本人考085602 化学工程 专硕 +7 不知道叫什么! 2026-03-15 8/400 2026-03-15 20:11 by 棒棒球手
[考研] 0703化学调剂,求各位老师收留 +7 秋有木北 2026-03-14 7/350 2026-03-15 17:30 by 小物理化学
[考研] 283求调剂 +6 小楼。 2026-03-12 9/450 2026-03-14 22:15 by cfxczx2015
[考研] 求调剂 +5 鹤遨予卿 2026-03-09 5/250 2026-03-14 02:44 by JourneyLucky
[考研] 293求调剂 +5 上班不着吉 2026-03-09 5/250 2026-03-14 02:37 by JourneyLucky
[考研] 求调剂 +3 清风问长安 2026-03-09 3/150 2026-03-14 02:15 by JourneyLucky
[考研] 332分材料工程调剂 +3 莓好时光海苔 2026-03-09 3/150 2026-03-14 02:03 by JourneyLucky
[考研] 云南财经大学信息学院计算机学硕专硕学位点 +3 zjptai 2026-03-10 5/250 2026-03-14 01:23 by 飞行琦
[考研] 一志愿安徽大学材料工程专硕313分,求调剂的学校 +8 Yu先生 2026-03-10 10/500 2026-03-14 01:04 by JourneyLucky
[考研] 341求调剂 +4 番茄头--- 2026-03-10 4/200 2026-03-13 23:12 by JourneyLucky
[考研] 0703,333分求调剂 一志愿郑州大学-物理化学 +3 李魔女斗篷 2026-03-11 3/150 2026-03-13 22:24 by JourneyLucky
[考研] 085600调剂 +5 漾漾123sun 2026-03-12 5/250 2026-03-13 22:06 by 星空星月
[考研] 26调剂/材料/英一数二/总分289/已过A区线 +6 步川酷紫123 2026-03-13 6/300 2026-03-13 21:59 by 星空星月
[考研] 材料与化工085600调剂求老师收留 +9 jiaanl 2026-03-11 9/450 2026-03-13 20:22 by JourneyLucky
[考研] 材料工程调剂 +4 咪咪空空 2026-03-11 4/200 2026-03-13 19:57 by JourneyLucky
[考研] 工科278分求调剂 +5 周慢热啊 2026-03-12 7/350 2026-03-13 15:49 by JourneyLucky
[考研] 274求调剂 +3 S.H1 2026-03-12 3/150 2026-03-13 15:15 by JourneyLucky
[考博] 福州大学杨黄浩课题组招收2026年专业学位博士研究生,2026.03.20截止 +3 Xiangyu_ou 2026-03-12 3/150 2026-03-13 09:36 by duanwu655
[硕博家园] 木虫好像不热闹了,是不是? +4 偏振片 2026-03-10 4/200 2026-03-10 09:51 by longwave
信息提示
请填处理意见