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各位大神们 小弟求助 有一质粒我想知道里面的序列 不知道怎么弄????
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zhuangkai520
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各位大神们 小弟求助 有一质粒我想知道里面的序列 不知道怎么弄????
我是从污水中筛选出的耐药大肠杆菌,想提取其中的有抗性基因的质粒进行测序,看后续实验对抗性基因-质粒的影响,应该怎么办呢???
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2013-11-15 09:42:30
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我个人愚见:
1. 从该株大肠杆菌中提取出所有质粒,该大肠杆菌可能含不止一种质粒
2. 然后这些质粒的混合体转化大肠杆菌DH5a或者其他克隆菌株用你的那个药筛选
3. 阳性菌株培养提取质粒
4. 想办法测序这个质粒
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2013-11-15 16:16:53
提取质粒,转化,amp/kana/氯霉素筛选阳性,再提质粒。10微升测序。
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求是
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2013-11-15 10:42:20
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2楼
:
Originally posted by
gyesang
at 2013-11-15 10:09:03
我个人愚见:
1. 从该株大肠杆菌中提取出所有质粒,该大肠杆菌可能含不止一种质粒
2. 然后这些质粒的混合体转化大肠杆菌DH5a或者其他克隆菌株用你的那个药筛选
3. 阳性菌株培养提取质粒
4. 想办法测序这个 ...
那这个质粒应该怎么测序啊?没什么谱?
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2013-11-15 11:56:02
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Originally posted by
jennifermatt
at 2013-11-15 10:42:20
提取质粒,转化,amp/kana/氯霉素筛选阳性,再提质粒。10微升测序。
直接测序质粒就可以吗??
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2013-11-15 11:56:23
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zhuangkai520
at 2013-11-15 11:56:02
那这个质粒应该怎么测序啊?没什么谱?...
那就要想办法了啊,因为你不知道该质粒的序列,所以你也不好设计测序引物,可以先将这个质粒用酶降解成片段,连到一个中间载体上,然后用中间载体测序,测出一段序列后,就可以继续测序啦
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先将这个质粒用酶降解成片段,连到T-easy载体上再测
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7楼
2013-11-15 19:43:43
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zh10246
at 2013-11-15 19:43:43
先将这个质粒用酶降解成片段,连到T-easy载体上再测
哦 了解了!
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8楼
2013-11-15 21:48:04
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