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zhuangkai520

金虫 (小有名气)

[求助] 各位大神们 小弟求助 有一质粒我想知道里面的序列 不知道怎么弄????

我是从污水中筛选出的耐药大肠杆菌,想提取其中的有抗性基因的质粒进行测序,看后续实验对抗性基因-质粒的影响,应该怎么办呢???
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深圳的东北人
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gyesang

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【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
kx444555: 金币+3, 鼓励交流 2013-11-15 16:12:14
我个人愚见:
1. 从该株大肠杆菌中提取出所有质粒,该大肠杆菌可能含不止一种质粒

2. 然后这些质粒的混合体转化大肠杆菌DH5a或者其他克隆菌株用你的那个药筛选

3. 阳性菌株培养提取质粒

4. 想办法测序这个质粒
学术问题讨论咨询发邮件gyesang@163.com
2楼2013-11-15 10:09:03
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jennifermatt

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励交流! 2013-11-15 16:16:53
提取质粒,转化,amp/kana/氯霉素筛选阳性,再提质粒。10微升测序。
求是
3楼2013-11-15 10:42:20
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zhuangkai520

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by gyesang at 2013-11-15 10:09:03
我个人愚见:
1. 从该株大肠杆菌中提取出所有质粒,该大肠杆菌可能含不止一种质粒

2. 然后这些质粒的混合体转化大肠杆菌DH5a或者其他克隆菌株用你的那个药筛选

3. 阳性菌株培养提取质粒

4. 想办法测序这个 ...

那这个质粒应该怎么测序啊?没什么谱?
深圳的东北人
4楼2013-11-15 11:56:02
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zhuangkai520

金虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by jennifermatt at 2013-11-15 10:42:20
提取质粒,转化,amp/kana/氯霉素筛选阳性,再提质粒。10微升测序。

直接测序质粒就可以吗??
深圳的东北人
5楼2013-11-15 11:56:23
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gyesang

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【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
zhuangkai520: 金币+10, ★★★★★最佳答案 2013-11-15 21:47:41
引用回帖:
4楼: Originally posted by zhuangkai520 at 2013-11-15 11:56:02
那这个质粒应该怎么测序啊?没什么谱?...

那就要想办法了啊,因为你不知道该质粒的序列,所以你也不好设计测序引物,可以先将这个质粒用酶降解成片段,连到一个中间载体上,然后用中间载体测序,测出一段序列后,就可以继续测序啦
学术问题讨论咨询发邮件gyesang@163.com
6楼2013-11-15 16:20:04
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zh10246

铁杆木虫 (文坛精英)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
先将这个质粒用酶降解成片段,连到T-easy载体上再测
7楼2013-11-15 19:43:43
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zhuangkai520

金虫 (小有名气)

引用回帖:
7楼: Originally posted by zh10246 at 2013-11-15 19:43:43
先将这个质粒用酶降解成片段,连到T-easy载体上再测

哦  了解了!
深圳的东北人
8楼2013-11-15 21:48:04
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