应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 【求助/交流】怎样在一段序列中查找可能的测序引物？
51/1返回列表
查看: 1625  |  回复: 4
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

kimiosn

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】怎样在一段序列中查找可能的测序引物？ 已有3人参与

质粒是前人传下来的，不知道背景，我根据里面连的外源片段设计了引物，测了一下外源片段的5’上游序列，有400bp左右，但是我想知道这里面有什么可以用的通用测序引物，有什么方法可以查一下？

谢谢帮助

PS：其实可以根据测出来的自己设计一段测序引物，但引物合成也需要时间，我想找个通用的测序引物可以快一点儿
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2010-07-01 19:28:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

kimiosn

银虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by ben1147 at 2010-07-01 19:32:27:
blast一下不就知道是什么载体了么

NCBI上也有能去掉载体序列的程序

谢谢，具体在哪儿呢？本人小白
赞一下 回复此楼
3楼2010-07-01 19:37:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 5 个回答

ben1147

木虫 (正式写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
amisking(金币+1):欢迎发帖交流！ 2010-07-01 21:14:37
blast一下不就知道是什么载体了么

NCBI上也有能去掉载体序列的程序
赞一下(2人) 回复此楼
2楼2010-07-01 19:32:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ben1147

木虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
amisking:good！ 2010-07-01 21:14:47
看天(金币+3):good! 2010-07-02 08:18:51
引用回帖:
Originally posted by kimiosn at 2010-07-01 19:37:03:


谢谢，具体在哪儿呢？本人小白

很多综合性的序列分析软件可以做到，比如DNAStar里面带的Seqman

NCBI的程序叫做VecScreen

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/VecScreen/VecScreen.html
赞一下(3人) 回复此楼
4楼2010-07-01 20:52:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

段家一凡

木虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by kimiosn at 2010-07-01 19:37:03:


谢谢，具体在哪儿呢？本人小白

BLASTN即可知道你的是什么载体，测序时你就直接说用某某载体的通用引物就可以了。
赞一下(1人) 回复此楼
5楼2010-07-02 01:10:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 5 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭