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ma_xiaowen

木虫 (正式写手)

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[求助] 想要设计引物可是NCBI中blast后只有蛋白序列如何得到基因序列谢谢啊

想要设计引物可是NCBI中blast后只有蛋白序列如何得到基因序列

我是想从一种真菌中P一个基因，但是找到了几个类似的，只能得到它的蛋白序列，却找不到基因序列，想问下虫友们，如何找到啊，或者是否能从蛋白序列去设计引物。

还有就是，在这一种病害的另一种致病菌中找相同的基因，就能找到基因序列，这是为什么啊？

DBSOURCE accession 点开了可是打开后也还是没有基因序列，是一部分一部分的蛋白序列

急需虫友们的帮助，小弟感激不尽啊

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1楼 2012-05-09 08:48:57

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yabxxh

木虫 (正式写手)

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【答案】应助回帖

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小丹木木: 金币+2, 鼓励交流 2012-05-11 13:43:48

听你的意思，你是想做同源克隆啊，那你就不用找什么基因序列了，估计目前没有发表的。同一个基因在不同物种里面一般会有高度保守的序列的，就像小鼠的Klotho基因和人的Klotho基因具有很高的同源性一样。
你可以找到这个蛋白的CDS序列（如果其CDS序列是标出来的），去Blast，然后取其高度保守的部分，设计兼并引物来进行PCR，这样就可以了。