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ma_xiaowen

木虫 (正式写手)

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[求助] 想要设计引物可是NCBI中blast后只有蛋白序列如何得到基因序列谢谢啊

想要设计引物可是NCBI中blast后只有蛋白序列如何得到基因序列

我是想从一种真菌中P一个基因，但是找到了几个类似的，只能得到它的蛋白序列，却找不到基因序列，想问下虫友们，如何找到啊，或者是否能从蛋白序列去设计引物。

还有就是，在这一种病害的另一种致病菌中找相同的基因，就能找到基因序列，这是为什么啊？

DBSOURCE accession 点开了可是打开后也还是没有基因序列，是一部分一部分的蛋白序列

急需虫友们的帮助，小弟感激不尽啊

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1楼 2012-05-09 08:48:57

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ma_xiaowen

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引用回帖:

6楼: Originally posted by yabxxh at 2012-05-10 15:28:37:
听你的意思，你是想做同源克隆啊，那你就不用找什么基因序列了，估计目前没有发表的。同一个基因在不同物种里面一般会有高度保守的序列的，就像小鼠的Klotho基因和人的Klotho基因具有很高的同源性一样。
你可以找 ...

用CDS确实能找到啊，不过5个里面只找到了三个，其他的两个，没有基因序列显示，只有下面这些东西，求解释啊，非常感谢啊
CONTIG    join(ABJE01000167.1:1..25706,gap(176),ABJE01000168.1:1..24274,
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