应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 通过什么实验可以获得新蛋白的基因序列？
121/2返回列表12下一页
查看: 2271  |  回复: 11
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

OBM2013

铜虫 (小有名气)

[求助] 通过什么实验可以获得新蛋白的基因序列？

现在前沿文献知道一个新蛋白质，但还没报道该蛋白的基因序列，各位大侠有何高见能够获得该蛋白的基因序列？小弟我对该方面的了解比较缺乏，恳请各位大侠指点，如果有相关的文献，最好附上。感激不尽！
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
成就理想
1楼 2013-09-10 17:14:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

feilinshiji

银虫 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by 生物工程师 at 2013-10-09 08:39:01
想请教一下，把数据库中没有的蛋白用质谱分析获得全序列的技术流程和相关思路是怎样的？本人也有相关的疑虑。谢谢！
PS：质谱分析肽质量指纹然后对比数据库中的蛋白，通过对比片段的相似性来找到数据库中与未知蛋 ...

跑PAGE胶的时候，你可以把阴阳性对照比对一下，然后把疑似条带切下来，回收纯化，送公司做质谱分析，看看数据库里有没有相应的蛋白。至于测序，一般采用Edman降解法，但是Edman法一次也只能测大概40个氨基酸，所以大分子需要进行水解处理，将其打碎成若干小片段。
赞一下(2人) 回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

生物工程师
8楼2013-10-09 09:22:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

feilinshiji

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
OBM2013: 金币+15, ★有帮助 2013-10-10 23:38:13
引用回帖:
5楼: Originally posted by OBM2013 at 2013-09-12 10:27:55
那个是新，发现的蛋白，NCBI上可能没有...

如果是新的蛋白的话，你可以送到公司做质谱分析，得到全序列
赞一下(1人) 回复此楼
6楼2013-09-19 10:01:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

生物工程师

木虫 (正式写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by feilinshiji at 2013-09-19 10:01:45
如果是新的蛋白的话，你可以送到公司做质谱分析，得到全序列...

想请教一下，把数据库中没有的蛋白用质谱分析获得全序列的技术流程和相关思路是怎样的？本人也有相关的疑虑。谢谢！
PS：质谱分析肽质量指纹然后对比数据库中的蛋白，通过对比片段的相似性来找到数据库中与未知蛋白对应的蛋白，这是常用的方法。测定未知蛋白的序列和这个思路相似吗？谢谢！
赞一下(1人) 回复此楼
7楼2013-10-09 08:39:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

feilinshiji

银虫 (小有名气)
引用回帖:
10楼: Originally posted by 生物工程师 at 2013-10-12 17:04:23
数据库里没有对应的蛋白的话，想获得序列只能通过酶解+edman测序？那酶解成小片段后测序如何还原成该蛋白的全序列呢？有相关软件吗？还原出来的全序列可信度高吗？还望赐教，谢谢！...

据我所知目前氨基酸测序基本上都是用这种方法。至于还原序列问题，这我还真的不是很清楚，我对这方面了解不是很深入，我记得好像生物公司的技术人员告诉我说是根据不同酶降解蛋白质的差异进行推断。
赞一下(1人) 回复此楼
11楼2013-10-12 19:40:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

wsh01300

铜虫 (小有名气)
★
kx444555: 金币+1, 鼓励交流 2013-09-11 11:46:39
没搞明白，你是看文献发现有这么一种蛋白，然后想知道这个蛋白的表达基因呢，还是说你手上已经有这么一种蛋白，然后你想通过实验获得这种蛋白的基因编码序列？如果是后一种的话我到是有些经验。
赞一下 回复此楼
2楼2013-09-11 09:46:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

OBM2013

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by wsh01300 at 2013-09-11 09:46:25
没搞明白，你是看文献发现有这么一种蛋白，然后想知道这个蛋白的表达基因呢，还是说你手上已经有这么一种蛋白，然后你想通过实验获得这种蛋白的基因编码序列？如果是后一种的话我到是有些经验。

我是后一种，我手头上有这么一种蛋白，还请你指导一下小弟我吧，谢谢大侠了
赞一下 回复此楼
成就理想
3楼2013-09-11 12:00:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hl16010921

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
kx444555: 金币+1, 鼓励交流 2013-09-12 12:13:53
Edman降解测序，只测一小段就行了，估计有10个氨基酸足够了。之后NCBI的BLast查同源蛋白，就能查到该基因了。
赞一下 回复此楼
4楼2013-09-11 13:43:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

OBM2013

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by hl16010921 at 2013-09-11 13:43:03
Edman降解测序，只测一小段就行了，估计有10个氨基酸足够了。之后NCBI的BLast查同源蛋白，就能查到该基因了。

那个是新，发现的蛋白，NCBI上可能没有
赞一下 回复此楼
成就理想
5楼2013-09-12 10:27:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

夏天的普洱茶

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
kx444555: 金币+2, 鼓励交流 2013-10-09 14:10:37
1纯化蛋白，然后进行氨基酸测序
2根据同源性设计简并引物，直接PCR
3基因文库
赞一下 回复此楼
9楼2013-10-09 14:05:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

生物工程师

木虫 (正式写手)
送红花一朵
引用回帖:
8楼: Originally posted by feilinshiji at 2013-10-09 09:22:41
跑PAGE胶的时候，你可以把阴阳性对照比对一下，然后把疑似条带切下来，回收纯化，送公司做质谱分析，看看数据库里有没有相应的蛋白。至于测序，一般采用Edman降解法，但是Edman法一次也只能测大概40个氨基酸，所以 ...

数据库里没有对应的蛋白的话，想获得序列只能通过酶解+edman测序？那酶解成小片段后测序如何还原成该蛋白的全序列呢？有相关软件吗？还原出来的全序列可信度高吗？还望赐教，谢谢！
赞一下 回复此楼
10楼2013-10-12 17:04:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 OBM2013 的主题更新
121/2返回列表12下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 可靠消息，8月21号(明天)放榜 +3 医学老男孩 2026-08-20 3/150 2026-08-20 09:50 by 突突小宝贝
[基金申请] 只有每年这种时候来逛逛小木虫 +20 yaoyewhu2008 2026-08-20 20/1000 2026-08-20 09:41 by 2026年国自然基�
[基金申请] 欢迎发来filecode的Mz6后的代码验证其规律 +55 医学老男孩 2026-08-13 125/6250 2026-08-20 09:02 by 医学老男孩
[基金申请] 今天基金会出结果吗？20260819 +14 kkkl_v 2026-08-19 15/750 2026-08-20 08:21 by sunzitan
[基金申请] filecode，4个jtjc了 +11 ziyangfang 2026-08-19 13/650 2026-08-19 21:28 by aasahr
[教师之家] 为什么余额宝的年化利率越来越低？主要原因有哪些？ +5 瞬息宇宙 2026-08-15 5/250 2026-08-19 20:23 by super2002521
[基金申请] 今天放榜没戏了吧 +4 yuleib84 2026-08-19 5/250 2026-08-19 19:52 by hhs666
[基金申请] 今天放榜吗？ +14 布布和一二 2026-08-19 15/750 2026-08-19 18:07 by gltch
[基金申请] filecode=后面第一个是大写字母 +10 wangze12014 2026-08-14 12/600 2026-08-19 16:56 by 苦难博士
[基金申请] 朋友圈看到的 +6 wangzilk 2026-08-18 8/400 2026-08-19 10:55 by Haru815
[基金申请] 快农历七夕节了，轻松一下，男人悄悄话，女施主请不要进来。 +6 Tide man 2026-08-14 7/350 2026-08-19 09:56 by ZJTJZ
[基金申请] 重要消息，中午系统在维护 +10 yuleib84 2026-08-18 11/550 2026-08-19 07:30 by 羽毛枫f
[论文投稿] 投稿咨询 +4 wwm09 2026-08-17 6/300 2026-08-18 15:36 by wwm09
[基金申请] 时间戳又变了8-15 +14 archvillain 2026-08-15 26/1300 2026-08-18 13:37 by phantomgost
[基金申请] 今天维护系统维护 祝所有人 高中 +8 gjjjzhong 2026-08-18 9/450 2026-08-18 13:01 by 家与远方
[基金申请] 哪位老哥知道今年的国自然具体哪一天放榜？ +13 Ldrop2023 2026-08-13 16/800 2026-08-18 12:25 by 淀粉搬运工
[基金申请] 感觉是下周放榜了 +6 angus9576 2026-08-17 11/550 2026-08-17 23:57 by angus9576
[基金申请] 今天系统多次维护，明天很可能放榜！ +8 zju2000 2026-08-16 9/450 2026-08-17 12:20 by lmz0216
[精细化工] 招聘 金属平磨液，抛光液研发工程师 +3 小天0311 2026-08-14 3/150 2026-08-16 07:31 by H9PLUS
[基金申请] 各位道友，我要去昆明玩几天，回来见。 +7 Tide man 2026-08-14 8/400 2026-08-15 01:11 by arzu_hma
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭