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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 实验/技术 » 序列相似度较低，该如何申请获得基因登陆号
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lixin601

木虫 (正式写手)

[交流] 序列相似度较低，该如何申请获得基因登陆号 已有3人参与

最近获得一株菌，经16s rRNA基因比对，发现与genbank中基因相似度最高只有92%，这是否说明其极有可能是一个新属呢？同时，我想获得这段基因的序列登陆号，以便发表论文（微生物多样性方面的），但现在不知该如何向genbank提交序列（主要是名字的问题），望高手指教，谢谢！
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1楼 2011-11-17 15:39:02
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匿名

用户注销 (著名写手)
★ ★
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zhang8826857(金币+1): 鼓励交流 2011-11-19 14:25:44
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2楼2011-11-18 17:45:54
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stone_f

铜虫 (初入文坛)
★ ★ ★ ★ ★ ★
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zhang8826857(金币+5): good 2011-11-19 14:25:37
不能通过16S比对得到菌种分类的都应该做生理生化鉴定的（其实严谨的就算是16S序列相似度高也应该做生理生化鉴定的）这样你在NCBI上传的时候才好命名，如何提交序列网上有详细的说明，就是要填的东西比较多，然后审核的时间比较长，我注册的时候是3月多，2天后就拿到了登录号，但是5月中旬才审核完公开。当初弄的时候自己也是迷迷糊糊弄的，没人教，所以现在也记不太清楚了，说错勿怪
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3楼2011-11-18 23:05:32
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godgirl

金虫 (正式写手)
★ ★
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zhang8826857(金币+1): 鼓励交流 2011-12-05 08:44:28
一，进一步做些实验确定是新种
二，将菌种在国内外两家不同的菌种保藏中心进行保藏获得菌种号
三，利用双名法对所得到的新种进行起名
四，在GENBAKN里提交大量的资料和说明，按着操作一步步来就知道了。
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4楼2011-12-04 22:18:30
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godgirl

金虫 (正式写手)
★
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名字问题你问我，双名法给新属起名我们实验室做过，对这个我了解，就不在这上面细说了，想知道可以与我联系。
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5楼2011-12-04 22:41:46
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