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lixin601

木虫 (正式写手)

[交流] 序列相似度较低,该如何申请获得基因登陆号 已有3人参与

最近获得一株菌,经16s rRNA基因比对,发现与genbank中基因相似度最高只有92%,这是否说明其极有可能是一个新属呢?同时,我想获得这段基因的序列登陆号,以便发表论文(微生物多样性方面的),但现在不知该如何向genbank提交序列(主要是名字的问题),望高手指教,谢谢!
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匿名

用户注销 (著名写手)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
zhang8826857(金币+1): 鼓励交流 2011-11-19 14:25:44
本帖仅楼主可见
2楼2011-11-18 17:45:54
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stone_f

铜虫 (初入文坛)

★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
zhang8826857(金币+5): good 2011-11-19 14:25:37
不能通过16S比对得到菌种分类的都应该做生理生化鉴定的(其实严谨的就算是16S序列相似度高也应该做生理生化鉴定的)这样你在NCBI上传的时候才好命名,如何提交序列网上有详细的说明,就是要填的东西比较多,然后审核的时间比较长,我注册的时候是3月多,2天后就拿到了登录号,但是5月中旬才审核完公开。当初弄的时候自己也是迷迷糊糊弄的,没人教,所以现在也记不太清楚了,说错勿怪
3楼2011-11-18 23:05:32
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godgirl

金虫 (正式写手)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
zhang8826857(金币+1): 鼓励交流 2011-12-05 08:44:28
一,进一步做些实验确定是新种
二,将菌种在国内外两家不同的菌种保藏中心进行保藏获得菌种号
三,利用双名法对所得到的新种进行起名
四,在GENBAKN里提交大量的资料和说明,按着操作一步步来就知道了。
4楼2011-12-04 22:18:30
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godgirl

金虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
名字问题你问我,双名法给新属起名我们实验室做过,对这个我了解,就不在这上面细说了,想知道可以与我联系。
5楼2011-12-04 22:41:46
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