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OBM2013

铜虫 (小有名气)

[求助] 通过什么实验可以获得新蛋白的基因序列?

现在前沿文献知道一个新蛋白质,但还没报道该蛋白的基因序列,各位大侠有何高见能够获得该蛋白的基因序列?小弟我对该方面的了解比较缺乏,恳请各位大侠指点,如果有相关的文献,最好附上。感激不尽!
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成就理想
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生物工程师

木虫 (正式写手)

送红花一朵
引用回帖:
8楼: Originally posted by feilinshiji at 2013-10-09 09:22:41
跑PAGE胶的时候,你可以把阴阳性对照比对一下,然后把疑似条带切下来,回收纯化,送公司做质谱分析,看看数据库里有没有相应的蛋白。至于测序,一般采用Edman降解法,但是Edman法一次也只能测大概40个氨基酸,所以 ...

数据库里没有对应的蛋白的话,想获得序列只能通过酶解+edman测序?那酶解成小片段后测序如何还原成该蛋白的全序列呢?有相关软件吗?还原出来的全序列可信度高吗?还望赐教,谢谢!
10楼2013-10-12 17:04:23
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wsh01300

铜虫 (小有名气)


kx444555: 金币+1, 鼓励交流 2013-09-11 11:46:39
没搞明白,你是看文献发现有这么一种蛋白,然后想知道这个蛋白的表达基因呢,还是说你手上已经有这么一种蛋白,然后你想通过实验获得这种蛋白的基因编码序列?如果是后一种的话我到是有些经验。
2楼2013-09-11 09:46:25
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OBM2013

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by wsh01300 at 2013-09-11 09:46:25
没搞明白,你是看文献发现有这么一种蛋白,然后想知道这个蛋白的表达基因呢,还是说你手上已经有这么一种蛋白,然后你想通过实验获得这种蛋白的基因编码序列?如果是后一种的话我到是有些经验。

我是后一种,我手头上有这么一种蛋白,还请你指导一下小弟我吧,谢谢大侠了
成就理想
3楼2013-09-11 12:00:44
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hl16010921

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
kx444555: 金币+1, 鼓励交流 2013-09-12 12:13:53
Edman降解测序,只测一小段就行了,估计有10个氨基酸足够了。之后NCBI的BLast查同源蛋白,就能查到该基因了。
4楼2013-09-11 13:43:03
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