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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 通过什么实验可以获得新蛋白的基因序列？
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OBM2013

铜虫 (小有名气)

[求助] 通过什么实验可以获得新蛋白的基因序列？

现在前沿文献知道一个新蛋白质，但还没报道该蛋白的基因序列，各位大侠有何高见能够获得该蛋白的基因序列？小弟我对该方面的了解比较缺乏，恳请各位大侠指点，如果有相关的文献，最好附上。感激不尽！
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成就理想
1楼 2013-09-10 17:14:58
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feilinshiji

银虫 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by 生物工程师 at 2013-10-09 08:39:01
想请教一下，把数据库中没有的蛋白用质谱分析获得全序列的技术流程和相关思路是怎样的？本人也有相关的疑虑。谢谢！
PS：质谱分析肽质量指纹然后对比数据库中的蛋白，通过对比片段的相似性来找到数据库中与未知蛋 ...

跑PAGE胶的时候，你可以把阴阳性对照比对一下，然后把疑似条带切下来，回收纯化，送公司做质谱分析，看看数据库里有没有相应的蛋白。至于测序，一般采用Edman降解法，但是Edman法一次也只能测大概40个氨基酸，所以大分子需要进行水解处理，将其打碎成若干小片段。
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生物工程师
8楼2013-10-09 09:22:41
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wsh01300

铜虫 (小有名气)
★
kx444555: 金币+1, 鼓励交流 2013-09-11 11:46:39
没搞明白，你是看文献发现有这么一种蛋白，然后想知道这个蛋白的表达基因呢，还是说你手上已经有这么一种蛋白，然后你想通过实验获得这种蛋白的基因编码序列？如果是后一种的话我到是有些经验。
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2楼2013-09-11 09:46:25
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OBM2013

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by wsh01300 at 2013-09-11 09:46:25
没搞明白，你是看文献发现有这么一种蛋白，然后想知道这个蛋白的表达基因呢，还是说你手上已经有这么一种蛋白，然后你想通过实验获得这种蛋白的基因编码序列？如果是后一种的话我到是有些经验。

我是后一种，我手头上有这么一种蛋白，还请你指导一下小弟我吧，谢谢大侠了
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成就理想
3楼2013-09-11 12:00:44
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hl16010921

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
kx444555: 金币+1, 鼓励交流 2013-09-12 12:13:53
Edman降解测序，只测一小段就行了，估计有10个氨基酸足够了。之后NCBI的BLast查同源蛋白，就能查到该基因了。
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4楼2013-09-11 13:43:03
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