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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 通过什么实验可以获得新蛋白的基因序列？
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OBM2013

铜虫 (小有名气)

[求助] 通过什么实验可以获得新蛋白的基因序列？

现在前沿文献知道一个新蛋白质，但还没报道该蛋白的基因序列，各位大侠有何高见能够获得该蛋白的基因序列？小弟我对该方面的了解比较缺乏，恳请各位大侠指点，如果有相关的文献，最好附上。感激不尽！
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成就理想
1楼 2013-09-10 17:14:58
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feilinshiji

银虫 (小有名气)
引用回帖:
10楼: Originally posted by 生物工程师 at 2013-10-12 17:04:23
数据库里没有对应的蛋白的话，想获得序列只能通过酶解+edman测序？那酶解成小片段后测序如何还原成该蛋白的全序列呢？有相关软件吗？还原出来的全序列可信度高吗？还望赐教，谢谢！...

据我所知目前氨基酸测序基本上都是用这种方法。至于还原序列问题，这我还真的不是很清楚，我对这方面了解不是很深入，我记得好像生物公司的技术人员告诉我说是根据不同酶降解蛋白质的差异进行推断。
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11楼2013-10-12 19:40:22
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wsh01300

铜虫 (小有名气)
★
kx444555: 金币+1, 鼓励交流 2013-09-11 11:46:39
没搞明白，你是看文献发现有这么一种蛋白，然后想知道这个蛋白的表达基因呢，还是说你手上已经有这么一种蛋白，然后你想通过实验获得这种蛋白的基因编码序列？如果是后一种的话我到是有些经验。
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2楼2013-09-11 09:46:25
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OBM2013

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by wsh01300 at 2013-09-11 09:46:25
没搞明白，你是看文献发现有这么一种蛋白，然后想知道这个蛋白的表达基因呢，还是说你手上已经有这么一种蛋白，然后你想通过实验获得这种蛋白的基因编码序列？如果是后一种的话我到是有些经验。

我是后一种，我手头上有这么一种蛋白，还请你指导一下小弟我吧，谢谢大侠了
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成就理想
3楼2013-09-11 12:00:44
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hl16010921

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
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kx444555: 金币+1, 鼓励交流 2013-09-12 12:13:53
Edman降解测序，只测一小段就行了，估计有10个氨基酸足够了。之后NCBI的BLast查同源蛋白，就能查到该基因了。
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4楼2013-09-11 13:43:03
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