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wcs0313

木虫 (正式写手)

[交流] 如何寻找目的基因 已有4人参与

请问大侠们，我现在有放线菌的全基因序列，但是好大啊，怎么能快速的知道这个genome sequence中是不是含有我所感兴趣的目的基因呢？
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1楼 2013-10-15 03:20:24
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yuhuaing

新虫 (初入文坛)
★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
gyesang: 金币+3, 鼓励回帖交流！ 2013-10-16 00:37:12
你感兴趣的目的基因编码产物一定是有某种特殊的生物学功能，如某种蛋白，所以，个人觉得，你可以找到能产生同样或者类似目的产物的其他生物，而该生物与该放线菌亲缘性较高且编码该产物的基因序列已知，根据该同源基因的保守区进行引物设计，以你自己的放线菌的全基因为模板进行PCR，看看能否扩增出你想要的目的条带。仅供参考，希望有点帮助。
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2楼2013-10-15 22:53:23
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黑盖儿

铁虫 (小有名气)
★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
kx444555: 金币+2, 鼓励交流 2013-10-16 14:57:23
既然已经有了基因序列了，你可以选取一段基因将他敲掉，看一看会发生什么症状；然后将这段基因转化到你所需要的目标菌株中，就可以确定这段基因在目标菌之中的作用了。
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我给不了你宝马香车，锦衣玉食，但我会用一辈子去疼你，爱你，保护你
3楼2013-10-16 14:29:05
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taccycle

铜虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
你知道你的目的基因的序列码，如果知道的话直接做个blast就好了啊
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用心
4楼2013-10-16 15:56:53
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jieke0633

金虫 (正式写手)

一路走 一直走
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
先做个本地blast，有结果的话再做pcr验证

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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只见海洋就以为没有陆地的人不过是拙劣的探索者！
5楼2013-10-16 16:42:26
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wcs0313

木虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by yuhuaing at 2013-10-15 22:53:23
你感兴趣的目的基因编码产物一定是有某种特殊的生物学功能，如某种蛋白，所以，个人觉得，你可以找到能产生同样或者类似目的产物的其他生物，而该生物与该放线菌亲缘性较高且编码该产物的基因序列已知，根据该同源基 ...

非常感谢
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6楼2013-10-16 23:16:26
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wcs0313

木虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by taccycle at 2013-10-16 15:56:53
你知道你的目的基因的序列码，如果知道的话直接做个blast就好了啊

非常感谢
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7楼2013-10-16 23:16:32
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