| 查看: 1982 | 回复: 7 | ||
zengsihai木虫 (小有名气)
iloveemuch
|
[求助]
测序结果不好的序列能够做系统发育树吗？ 已有2人参与
|
|
各位虫友： 小弟对一株真菌PCR其ITS区，送测序后效果不好，要求是双向测序并且拼接，但是生工告知无法拼接，仅有两条两个方向的测序结果。但是，BLASTN比对有找到相似性，与Fusarium solani相似达99%，可以知道该菌应该是茄镰刀菌了，但是我尝试在NCBI上下载它的一些近似种镰刀菌，拟做一个系统发育树，以期进一步分析它的种属，好提炼一些观点，可是用CLUSTAL X和MEGA6.0，发现待分析序列与下载的已知序列相比，一段一段的，能做出系统发育树吗？ 虫友，象我这种情况，仅有一个方向的序列能够做出系统发育树吗，盼您的指教。 |
回复此楼» 猜你喜欢
不合理蛙科研实验中的趣事：实验器材的 “乌龙”
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验中的趣事：和实验材料的 “斗智斗勇”
已经有0人回复
-
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有271人回复
-
蛋白质检测：精准分析，解锁生物分子的密码
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之小鼠实验：严谨设计，解析生命机制的重要载体
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之重金属检测：精准筛查，守护健康与环境的防线
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之“蛙测重金属我背锅三千”
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之“鼠逃三次我发三篇SCI”
已经有0人回复
-
纳米粒度分析
已经有3人回复
-
林科院林化所招收材料与化工专业硕士，坐标南京
已经有0人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 做了nosZ的功能基因，测序结果如下，我应该怎么分析呢？
已经有7人回复
- 细菌16S rDNA测序结果有了，如何建立系统发育树啊，之前的贴子没看懂。
已经有9人回复
- 不知道选怎样的序列进行系统发育树的构建，选多少？
已经有9人回复
- 求助 通过CLUSTAL软件进行多序列比对，利用MEGA4.0软件构建系统发育树
已经有12人回复
- 有关构建细菌发育树的序列问题
已经有8人回复
- 双向测序序列拼接不起来
已经有8人回复
- 求助 测序得到条带NCBI上没有同源序列
已经有8人回复
- 系统发育树里，为何自己测序的序列都聚成一簇
已经有6人回复
- 测序结果去除载体序列
已经有3人回复
- 在做系统发育树的时候，如何从genbank上选择下载同源序列呢
已经有10人回复
- 系统发育树 值都低于70%，求助
已经有11人回复
- 已经克隆测序到了matK序列，如何界定？急切求助中，谢谢！
已经有10人回复
- 构建系统发育树时，最后发表使用哪棵树？如何使用结果
已经有5人回复
- 这样还有必要建系统发育树吗？
已经有10人回复
- 系统发育树如何分析，得出结论？
已经有13人回复
- 有没有谁知道如何构建系统发育树呀？
已经有8人回复
- 【求助】关于测序后序列对比的问题
已经有5人回复
- 【求助/交流】测序出来的序列如何转换成氨基酸序列进行比对？
已经有9人回复
- 【求助/交流】16S rDNA测序 系统发育树构建 急！！！
已经有6人回复
- 【求助/交流】如何构建系统更发育树
已经有16人回复
2楼2014-09-10 22:50:37
zengsihai
木虫 (小有名气)
iloveemuch
- 应助: 4 (幼儿园)
- 金币: 3098.7
- 帖子: 101
- 在线: 62.7小时
- 虫号: 3196274
- 注册: 2014-05-10
- 性别: GG
- 专业: 植物病理学
3楼2014-09-11 06:19:40
4楼2014-09-11 08:15:44
5楼2014-09-11 09:41:43
zengsihai
木虫 (小有名气)
iloveemuch
- 应助: 4 (幼儿园)
- 金币: 3098.7
- 帖子: 101
- 在线: 62.7小时
- 虫号: 3196274
- 注册: 2014-05-10
- 性别: GG
- 专业: 植物病理学
6楼2014-09-11 10:51:49
zengsihai
木虫 (小有名气)
iloveemuch
- 应助: 4 (幼儿园)
- 金币: 3098.7
- 帖子: 101
- 在线: 62.7小时
- 虫号: 3196274
- 注册: 2014-05-10
- 性别: GG
- 专业: 植物病理学
7楼2014-09-11 10:53:32
8楼2014-09-11 13:33:12
