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luoxiaofeng

新虫 (初入文坛)

[交流] 【求助/交流】测序出来的序列如何转换成氨基酸序列进行比对? 已有7人参与

测序出来的序列如何转换成氨基酸序列进行比对?
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brightfuture01

木虫之王 (文坛精英)

我爱打老虎

文献杰出贡献

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
rainwander(金币+1):鼓励积极参与交流~~~ 2011-01-14 14:16:31
NCBI的 ORFinder 就可以实现在线转换氨基酸序列,然后在线比对。
The world is a fine place and worth fighting for. I agree with the second part.
2楼2011-01-14 11:29:13
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ben1147

木虫 (正式写手)

★
rainwander(金币+1):呵呵,“实在闲的无聊”....那可得时间了~~~ 2011-01-14 14:17:04
各种序列分析软件(BioEdit、DNAMAN等等等等)、各种数据库都可以实现,这是最基本的功能了
实在闲的无聊,对着密码子表手工来也是可以的
3楼2011-01-14 13:43:16
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wqj1988926

金虫 (正式写手)

★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
看你实验是真核还是原核细胞,两种不一样
风雪夜归人
4楼2011-01-14 16:43:27
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luoxiaofeng

新虫 (初入文坛)

谢谢,我就是连最基本的不知道,所以才能请假各位!我用的DNAMAN,请问可以说的具体点吗?非常感谢
5楼2011-01-14 18:17:58
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翱宇

禁虫 (正式写手)

将军

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
scelab(金币+1):忽忽~~~ 2011-01-15 01:41:04
引用回帖:
Originally posted by luoxiaofeng at 2011-01-14 18:17:58:
谢谢,我就是连最基本的不知道,所以才能请假各位!我用的DNAMAN,请问可以说的具体点吗?非常感谢

将DNA序列拷贝进去,点击ctrl+A,全部选中序列,然后点击工具栏的“seq”将序列激活,然后点击translation,翻译就行了!
具体的摸索下
6楼2011-01-14 19:04:36
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xp198766

铁杆木虫 (著名写手)

小木虫职业打酱油滴~~!

★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
我学得2楼说的ORF FINDER不错,直接把序列输进去就行了~~
7楼2011-01-14 19:54:36
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luoxiaofeng

新虫 (初入文坛)

非常感谢
8楼2011-01-14 21:57:23
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luoxiaofeng

新虫 (初入文坛)

我把序列DNA序列翻译之后,好像不对啊,DNA序列没有"U"碱基?谢谢
9楼2011-01-14 22:07:48
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fangchaoqi

新虫 (初入文坛)

★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
把序列的起始密码子放在起始位置 ,然后再translation
10楼2011-01-14 22:32:11
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