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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 知道氨基酸序列，如何得知核苷酸序列
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paulajjh

木虫 (著名写手)

[求助] 知道氨基酸序列，如何得知核苷酸序列

如题，我目前从NCBI上找到一段氨基酸序列，是全基因组一段，但是我找不到其核苷酸序列，blast（tblastn         Search translated nucleotide database using a protein query）也没有，请问，这种情况我如何去找到其对应的核苷酸序列？
如果没有报道，我又如何去得到核苷酸序列呢？
谢谢各位虫友。
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1楼 2011-12-01 11:12:16
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回帖置顶 ( 共有1个 )

chenchuan24891

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

amisking: 回帖置顶 2011-12-01 19:37:23
paulajjh(金币+1): 同一页没有，我后来通过别的网站找到了，可是blast还是找不到，很奇怪 2011-12-02 08:39:33
还是通过那个NCBI，只要有这段序列，就能知道这个是个什么蛋白，知道这个蛋白之后，再去搜索这个蛋白，下面就有对应的核苷酸序列了，我不知道你是怎么找到氨基酸的序列，应该同一页面下也会有蛋白序列的呀！
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4楼2011-12-01 16:20:11
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普通回帖

jiangyhai

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

paulajjh(金币+1): 2011-12-02 08:39:45
你可以基因合成，也可以设计兼并引物来扩增。
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静心做事。
2楼2011-12-01 15:53:24
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qiujun8982

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

paulajjh(金币+1): 2011-12-02 08:39:59
如果在NCBI上找到氨基酸的序列，用Blast查找一下是哪个蛋白的，然后在搜到这个蛋白，氨基酸对应的核苷酸序列就有了。
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3楼2011-12-01 16:08:01
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lwtong8320

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

paulajjh(金币+1): 我也认为这样，可是还是没有。 2011-12-03 08:33:36
全基因组序列既然已经测出来了，应该很容易查到核苷酸序列的，KEGG应该也可以。Blast找不到是什么意思？Blast时找不到相对应的序列？
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努力！努力！再努力！
5楼2011-12-02 15:54:25
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unforget408

铜虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by chenchuan24891 at 2011-12-01 16:20:11
还是通过那个NCBI，只要有这段序列，就能知道这个是个什么蛋白，知道这个蛋白之后，再去搜索这个蛋白，下面就有对应的核苷酸序列了，我不知道你是怎么找到氨基酸的序列，应该同一页面下也会有蛋白序列的呀！

这个应该是正解
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6楼2014-01-10 12:39:40
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