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honglanbai

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助/交流】已知N端11个氨基酸序列如何设计引物

已知N端11个氨基酸序列如何设计引物啊，C端打算用OligoDT引物。就知道这几个氨基酸，还用找保守区吗？
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1楼 2011-01-06 13:19:33
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amilie030312

金虫 (正式写手)
★
dhd997(金币+1):鼓励交流 2011-01-06 15:35:25
如果是我做，我会用C端的ODT前面随便加几个序列先试试看，看能不能拉出来，如果不出再分段扩就要找保守序列了。
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2楼2011-01-06 13:24:16
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lxj341401

至尊木虫 (著名写手)
★
dhd997(金币+1):鼓励交流 2011-01-06 15:35:35
利用N端5-6个氨基酸设计兼并一条引物。
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3楼2011-01-06 14:35:01
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翱宇

禁虫 (正式写手)
★
dhd997(金币+1):鼓励交流 2011-01-06 15:35:44
honglanbai(金币+1): 2011-03-08 14:27:17
我会从这N端这些氨基酸，blast找到蛋白序列，确定什么基因，在设计引物验证自己的推断！
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4楼2011-01-06 14:37:00
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honglanbai

木虫 (正式写手)
blast不到完全一样的氨基酸序列，一般都差一个或两个氨基酸
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5楼2011-01-06 14:53:41
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honglanbai

木虫 (正式写手)
一共才11个氨基酸
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6楼2011-01-06 14:58:11
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amilie030312

金虫 (正式写手)
★ ★
dhd997(金币+2):谢谢交流 2011-01-10 16:42:58
honglanbai(金币+1): 2011-03-08 14:27:05
差几个也是一样能扩出来的，当然普通Taq可以，高保真酶就不行了，先用Taq扩，等扩出来了大概的序列知道了再用高保真的酶扩，一般是这个流程吧
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7楼2011-01-10 15:52:22
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