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honglanbai

木虫 (正式写手)

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[交流] 【求助/交流】已知N端11个氨基酸序列如何设计引物

已知N端11个氨基酸序列如何设计引物啊，C端打算用OligoDT引物。就知道这几个氨基酸，还用找保守区吗？

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1楼 2011-01-06 13:19:33

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amilie030312

金虫 (正式写手)

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★
dhd997(金币+1):鼓励交流 2011-01-06 15:35:25

如果是我做，我会用C端的ODT前面随便加几个序列先试试看，看能不能拉出来，如果不出再分段扩就要找保守序列了。

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2楼2011-01-06 13:24:16

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lxj341401

至尊木虫 (著名写手)

★
dhd997(金币+1):鼓励交流 2011-01-06 15:35:35

利用N端5-6个氨基酸设计兼并一条引物。

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3楼2011-01-06 14:35:01

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翱宇

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★
dhd997(金币+1):鼓励交流 2011-01-06 15:35:44
honglanbai(金币+1): 2011-03-08 14:27:17

我会从这N端这些氨基酸，blast找到蛋白序列，确定什么基因，在设计引物验证自己的推断！

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4楼2011-01-06 14:37:00

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honglanbai

木虫 (正式写手)

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blast不到完全一样的氨基酸序列，一般都差一个或两个氨基酸

5楼2011-01-06 14:53:41

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honglanbai

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一共才11个氨基酸

6楼2011-01-06 14:58:11

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amilie030312

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dhd997(金币+2):谢谢交流 2011-01-10 16:42:58
honglanbai(金币+1): 2011-03-08 14:27:05

差几个也是一样能扩出来的，当然普通Taq可以，高保真酶就不行了，先用Taq扩，等扩出来了大概的序列知道了再用高保真的酶扩，一般是这个流程吧

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7楼2011-01-10 15:52:22

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