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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 蛋白氨基酸序列分析及二、三、四级结构的鉴定
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txyamy

木虫 (小有名气)

[求助] 蛋白氨基酸序列分析及二、三、四级结构的鉴定

RT，本人想分离纯化蛋白，然后对其纯蛋白进行氨基酸序列分析及二、三、四级结构的鉴定， 想请教下高人，这个纯蛋白进行氨基酸序列分析用MADI-TOF质谱仪可以分析吗？还是需要送样，以及主要的测序公司怎么找呢？ 另外蛋白分离纯化过程中，已经变性，接下来的结构还有希望吗？请高人指点。 不胜感激啊！
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1楼 2011-10-26 17:16:07
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txyamy

木虫 (小有名气)
怎么都木有人回复下呢！自己做板凳啦~期待大家过来交流 给俺点灵感呀~~
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2楼2011-10-26 21:35:30
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zhengfan1109

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
adslye(金币+2): 鼓励交流，祝顺利！ 2011-10-27 09:31:13
txyamy(金币+10): 谢谢啊，那请问下，您说的二级结构N端蛋白测序是Edam降解，那调取基因是仪器可以一次性完成，还是要自己再做，不懂，别拍砖啊，呵呵 2011-10-27 11:05:29
二级结构可以通过N端蛋白测序，调取基因，基因测序，获得相应基因序列，从而得到蛋白序列信息。
三级结构：X 射线晶体衍射分析。
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3楼2011-10-26 22:33:35
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chris9981

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★
adslye(金币+2): 鼓励交流~祝顺利！ 2011-10-27 09:31:42
txyamy(金币+10): 是测蛋白各级结构 一级结构，就是氨基酸序列?????????用MADI-TOF-MS/MS是吗？ 2011-10-27 11:30:49
单纯的TOF不能解析蛋白质的氨基酸序列，需
要用氨基酸序列分析仪，或者二级MS也有可能。
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4楼2011-10-27 08:19:44
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辉辉集团

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
adslye(金币+2): 鼓励交流~祝顺利！ 2011-10-27 09:31:55
txyamy(金币+5): 哈哈，是氨基酸测序仪，一般测15-20个氨基酸就可以的那种吗 2011-10-27 11:36:44
我只用过氨基酸测序，测一级结构
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5楼2011-10-27 08:33:17
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辉辉集团

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

txyamy(金币+10): 那你用的什么仪器呀？ 2011-10-27 14:43:54
引用回帖:
1楼: Originally posted by txyamy at 2011-10-26 17:16:07:
RT，本人想分离纯化蛋白，然后对其纯蛋白进行氨基酸序列分析及二、三、四级结构的鉴定， 想请教下高人，这个纯蛋白进行氨基酸序列分析用MADI-TOF质谱仪可以分析吗？还是需要送样，以及主要的测序公司怎么找呢？ 另 ...

嗯 是的 一般最多测25个差不多了
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6楼2011-10-27 12:09:27
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amms_8

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

纯化蛋白后，直接测定其序列成本会很高。
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7楼2011-10-27 15:48:14
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辉辉集团

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

txyamy(金币+5): 3Q~，国内的吗？可以介绍下公司吗？ 2011-10-27 19:57:51
引用回帖:
1楼: Originally posted by txyamy at 2011-10-26 17:16:07:
RT，本人想分离纯化蛋白，然后对其纯蛋白进行氨基酸序列分析及二、三、四级结构的鉴定， 想请教下高人，这个纯蛋白进行氨基酸序列分析用MADI-TOF质谱仪可以分析吗？还是需要送样，以及主要的测序公司怎么找呢？ 另 ...

仪器名字我有点忘记了 好像是ABI
我们学校没有的 我们是找公司测定的
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8楼2011-10-27 17:02:19
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辉辉集团

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
7楼: Originally posted by amms_8 at 2011-10-27 15:48:14:
纯化蛋白后，直接测定其序列成本会很高。

相对于一般的测定 费用是有点高的 不过还是在可以接受的范围内
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9楼2011-10-27 17:03:14
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xiaoche

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

txyamy(金币+10): 谢谢，我现在知道是什么蛋白，只是想再知道不同物种间蛋白序列的差异，这个质谱你用的是什么质谱呢？以及软件都用什么软件呀？谢谢啊 2011-10-27 20:11:39
纯化的蛋白可以打质谱，然后就能知道是什么蛋白了，再依据序列用软件分析二级三级等结构就可以吧。
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10楼2011-10-27 18:33:16
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