应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 有什么软件可以把多个核苷酸序列翻译成氨基酸的序列
151/2返回列表12下一页
查看: 4034  |  回复: 14
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

yuxuewawa

新虫 (初入文坛)

[求助] 有什么软件可以把多个核苷酸序列翻译成氨基酸的序列 已有1人参与

核苷酸序列由TXT和fasta两种格式，但是我有上千个序列，都分别放在不同的TXT中，怎么一次性把所有的核苷酸序列都翻译成氨基酸序列啊！
回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

yuxuewawa

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2012-10-24 21:38:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

wizardfan

至尊木虫 (著名写手)

优秀版主

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
yuxuewawa: 金币+1 2012-10-28 14:35:46
你这种情况，最好是写个简单的perl程序，完成2个功能，1）读指定目录下的所有文件，2）对每个文件进行处理。小木虫有资源，搜下bioinformatics, perl就行了。
如果是少数几个文件的话，bioedit很好用
赞一下(1人) 回复此楼
2楼2012-10-25 07:32:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

跑步的蜗牛

捐助贵宾 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
yuxuewawa: 金币+1, ★有帮助 2012-10-28 14:20:30
个人比较习惯使用mega，具体操作就是你先把不同序列以fasta格式黏贴至记事本，然后将记事本保存为fasta格式。然后再选择用mega打开。打开之后就有一个选项是将核酸序列翻译为蛋白质的。祝好运！
赞一下(1人) 回复此楼
10楼2012-10-26 16:05:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

yuxuewawa

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by wizardfan at 2012-10-25 07:32:48
你这种情况，最好是写个简单的perl程序，完成2个功能，1）读指定目录下的所有文件，2）对每个文件进行处理。小木虫有资源，搜下bioinformatics, perl就行了。
如果是少数几个文件的话，bioedit很好用

不懂perl，只懂点matlab。有办法做吗？
赞一下 回复此楼
3楼2012-10-25 09:32:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhangb

木虫 (小有名气)
下载一个primer,然后将你的序列导进去，然后选择里面的“protein"就可以啦。里面有三种翻译方式任你选
赞一下 回复此楼
4楼2012-10-25 10:18:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yuxuewawa

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
4楼: Originally posted by zhangb at 2012-10-25 10:18:19
下载一个primer,然后将你的序列导进去，然后选择里面的“protein"就可以啦。里面有三种翻译方式任你选

下了DNASTAR和DNAMAN这两个软件，但是都不太会用，试了一下就能一次分析一个序列。。。。
我试一下你说的这个方法，先感谢一下
赞一下 回复此楼
5楼2012-10-25 10:29:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yuxuewawa

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
4楼: Originally posted by zhangb at 2012-10-25 10:18:19
下载一个primer,然后将你的序列导进去，然后选择里面的“protein"就可以啦。里面有三种翻译方式任你选

能说的再清楚点不？我是新手。。。
赞一下 回复此楼
6楼2012-10-25 10:50:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tjuhsd

银虫 (小有名气)
试试MEGA
回复此楼
7楼2012-10-25 16:48:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhangb

木虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by yuxuewawa at 2012-10-25 10:50:45
能说的再清楚点不？我是新手。。。...

primer一次只能翻译一个完整的核苷酸序列，不能同时把不同文档中的序列翻译出来！惭愧，本人见识有限，至于同时翻译多个文档中的软件目前还不知道！至于DNAMAN倒可以同时导入N个文档中的序列，但序列要么是DNA，要么protein，貌似不能同时翻译多个文档中的DNA序列
赞一下 回复此楼
8楼2012-10-26 10:55:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

风诺2010

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
yuxuewawa: 金币+1 2012-10-28 14:36:12
立顶 Vector NTI 11
赞一下 回复此楼
9楼2012-10-26 15:42:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 yuxuewawa 的主题更新
151/2返回列表12下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭