应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 存档旧帖 » 核苷酸同源性高，但氨基酸没有同源性，有可能吗
91/1返回列表
查看: 3773  |  回复: 8
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

恶魔眼球

木虫 (小有名气)

[求助] 核苷酸同源性高，但氨基酸没有同源性，有可能吗

如题。测序回来的序列经过校对后，与其他物种进行比对，得到高同源性。。但是将其转化为氨基酸序列后，再进行比对。。却发现没有物种与之有同源性。。
理论上不是应该氨基酸获得的同源性更高吗？会不会是转化上出问题呢？转化需要注意些什么吗？
各位大侠，指点指点吧~在此先拜谢了~
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2012-08-30 11:12:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chenguestc

木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
小丹木木: 金币+2, 鼓励交流 2012-08-30 14:47:12
恶魔眼球: 金币+5, ★有帮助 2012-08-31 08:34:03
在翻译过程中，请选择FRAME1，2，3分别翻译后比对。按道理，核苷酸序列如果同源性很高，氨基酸应该有有很好的同源性，虽然可能有一些氨基酸变异。
赞一下 回复此楼
2楼2012-08-30 13:09:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

恶魔眼球

木虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by chenguestc at 2012-08-30 13:09:34
在翻译过程中，请选择FRAME1，2，3分别翻译后比对。按道理，核苷酸序列如果同源性很高，氨基酸应该有有很好的同源性，虽然可能有一些氨基酸变异。

3种都试了，依然不行。。会是什么原因呢
赞一下 回复此楼
3楼2012-08-30 17:04:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chenguestc

木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
恶魔眼球: 金币+5, ★有帮助 2012-08-31 08:34:15
请到NCBI里把你的核苷酸序列输入，然后用BLASTX比对看，不用自己翻译，NCBI就直接用你的核苷酸自己翻译然后给你比对出氨基酸序列
赞一下 回复此楼
4楼2012-08-31 06:47:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

恶魔眼球

木虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by chenguestc at 2012-08-31 06:47:51
请到NCBI里把你的核苷酸序列输入，然后用BLASTX比对看，不用自己翻译，NCBI就直接用你的核苷酸自己翻译然后给你比对出氨基酸序列

嗯。。试过了。。谢啦~
回复此楼
5楼2012-08-31 08:33:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xbl3688

银虫 (正式写手)
某些物种偏好一些稀有密码子，核苷酸密码子的三个碱基中有一个存在差异，翻译出的氨基酸就有可能不一样。但是这种情况也不会很离谱，氨基酸序列至少还是有一些同源性的。
赞一下 回复此楼
生活的乐趣在于善于发现美，学会欣赏美
6楼2012-08-31 09:04:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

547star

木虫 (著名写手)
最常见的原因是核酸序列中多个地方含有插入或缺失,导致6框翻译虽然一段段氨基酸相似,但因为不同时正确出现,而显示氨基酸序列相似性不高.处理的方法是先找正确的核酸序列(ORF比较长，完整的），作为对照序列与目标序列比对，把目标序列有插入或缺失的序列先修改（删除/添加的碱基可以参考对照序列），最容易出现测序错误的地方是连续相同的碱基的部分，如果有测序彩图，可以拿来重点分析出现连续碱基的地方，以得到更贴近实际的序列。修改过后的序列就都能得到相似性比较高的氨基酸序列，可以做进一步分析。
赞一下(1人) 回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

恶魔眼球
为什么
7楼2012-08-31 11:14:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

恶魔眼球

木虫 (小有名气)
送鲜花一朵
引用回帖:
7楼: Originally posted by 547star at 2012-08-31 11:14:47
最常见的原因是核酸序列中多个地方含有插入或缺失,导致6框翻译虽然一段段氨基酸相似,但因为不同时正确出现,而显示氨基酸序列相似性不高.处理的方法是先找正确的核酸序列(ORF比较长，完整的），作为对照序列与目标序 ...

回答得很详细，谢谢啦~
赞一下 回复此楼
8楼2012-09-01 16:55:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

mitocam

新虫 (正式写手)
不符合进化规律。
回复此楼
9楼2012-09-02 04:21:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 恶魔眼球 的主题更新
91/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭