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恶魔眼球

木虫 (小有名气)

[求助] 核苷酸同源性高,但氨基酸没有同源性,有可能吗

如题。测序回来的序列经过校对后,与其他物种进行比对,得到高同源性。。但是将其转化为氨基酸序列后,再进行比对。。却发现没有物种与之有同源性。。
理论上不是应该氨基酸获得的同源性更高吗?会不会是转化上出问题呢?转化需要注意些什么吗?
各位大侠,指点指点吧~在此先拜谢了~
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chenguestc

木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
恶魔眼球: 金币+5, 有帮助 2012-08-31 08:34:15
请到NCBI里把你的核苷酸序列输入,然后用BLASTX比对看,不用自己翻译,NCBI就直接用你的核苷酸自己翻译然后给你比对出氨基酸序列
4楼2012-08-31 06:47:51
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chenguestc

木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
小丹木木: 金币+2, 鼓励交流 2012-08-30 14:47:12
恶魔眼球: 金币+5, 有帮助 2012-08-31 08:34:03
在翻译过程中,请选择FRAME1,2,3分别翻译后比对。按道理,核苷酸序列如果同源性很高,氨基酸应该有有很好的同源性,虽然可能有一些氨基酸变异。
2楼2012-08-30 13:09:34
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恶魔眼球

木虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by chenguestc at 2012-08-30 13:09:34
在翻译过程中,请选择FRAME1,2,3分别翻译后比对。按道理,核苷酸序列如果同源性很高,氨基酸应该有有很好的同源性,虽然可能有一些氨基酸变异。

3种都试了,依然不行。。会是什么原因呢
3楼2012-08-30 17:04:34
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恶魔眼球

木虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by chenguestc at 2012-08-31 06:47:51
请到NCBI里把你的核苷酸序列输入,然后用BLASTX比对看,不用自己翻译,NCBI就直接用你的核苷酸自己翻译然后给你比对出氨基酸序列

嗯。。试过了。。谢啦~
5楼2012-08-31 08:33:40
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