| 查看: 30 | 回复: 0 | |||
[交流]
Calderasib理化性质与实验操作技术笔记
|
|
导语 KRAS 是人类基因组中突变频率最高的原癌基因之一，其中 G12C 突变在非小细胞肺癌中约占 13%，在结直肠癌中约占 3%-4%。过去数十年里，KRAS 因蛋白表面缺乏清晰的结合口袋被普遍视为"难以成药"，直到共价化学取得突破，这一局面才被改写。Calderasib（研发代号 MK-1084，CAS: 2641216-67-1）是默沙东（MSD）开发的口服 KRAS G12C 小分子抑制剂，目前已进入 III 期注册研究阶段，是 KRAS 研究工具箱中关注度快速上升的新成员。本文从靶点机制、结构特征、实验操作到供应链选型做一次系统梳理，供相关课题组参考。 Calderasib 是什么：从 KRAS G12C 突变说起 KRAS 蛋白是细胞增殖与分化信号网络中的关键"分子开关"，在 GDP 结合态与 GTP 结合态之间循环切换。当 12 位甘氨酸突变为半胱氨酸（G12C）后，突变体丧失 GTP 水解能力，长期锁定在与 GTP 结合的活化状态，驱动下游信号持续导通。 2013 年，Ostrem 等人在 Nature 上首次报道了可与 KRAS G12C 突变体中半胱氨酸残基发生共价结合的小分子系列，证明隐藏在 switch II 区域的这个变构口袋是可以被化学干预的——这是 KRAS 共价调控研究的奠基性工作。此后十余年，sotorasib 与 adagrasib 相继获批上市，而 Calderasib 正是沿这条化学路线迭代出的新一代候选分子：分子式 C32H31ClF2N6O4，分子量约 637.1，口服给药，目前在全球开展 KANDLELIT 系列 III 期研究，覆盖 KRAS G12C 突变的非小细胞肺癌、结直肠癌等适应症。 对科研工作者而言，Calderasib 的价值不止于其开发进度。作为一个结构公开、纯度可控的高选择性共价分子，它为 KRAS G12C 相关的细胞模型验证、化合物对照实验与 assay 开发提供了重要的阳性参考工具。 结构特征与研究价值 从化学结构看，Calderasib 包含典型的共价弹头与变构口袋结合骨架：氯、氟取代基用于调节代谢稳定性与亲脂性，含氮杂环部分与 switch II 口袋内的关键残基形成氢键网络，共价弹头则与 G12C 突变引入的半胱氨酸巯基发生选择性反应。这种"非共价锚定 + 共价捕获"的双模式设计，是当代 KRAS G12C 分子共同的技术路线。 理化层面，Calderasib 分子量约 637.1，属于典型的高脂溶性口服小分子，水溶性有限，实验配制以 DMSO 母液为主。含氯结构使其质谱图呈现特征的 3:1 同位素双峰，可作为谱学核验的辅助判据；多杂环与酰胺键的存在则要求储存环节严格避光防潮。这些理化特征共同决定了它在细胞实验中的使用方式：以母液形式逐级稀释，避免直接投入水性体系。 研究价值体现在三个层面。 一是作为阳性对照。在 KRAS G12C 相关细胞系的实验设计中，需要已知活性的共价分子作为参照，Calderasib 的选择性与效力数据在多项研究中已有报道，适合作为工具分子使用。 二是用于机制验证。2025 年 ESMO 年会上公布的 KANDLELIT-001（NCT05067283）I 期研究数据显示：结直肠癌人群客观缓解率为 38%，非小细胞肺癌人群为 38%，其他实体瘤人群为 34%，中位无进展生存期分别为 6.2、8.3 与 5.7 个月。这组数据为其在体外模型中的表现提供了可对照的基准。 三是支持联合策略探索。KANDLELIT 系列中有多项研究将 Calderasib 与 EGFR 单抗、PD-1/PD-L1 单抗联合评估，为研究下游通路补偿与耐药机制的课题组提供了新的组合参考。 实验操作与质控要点 溶解与母液配制。Calderasib 为固体粉末，常规以 DMSO 配制高浓度母液。通用做法是：首次配制前将粉末置于室温回温，加入 DMSO 后涡旋或轻柔吹打至溶液澄清，按单次用量分装至棕色进样瓶，-20°C 避光冻存，避免反复冻融导致析出。该类分子在水相体系中溶解度有限，直接加入培养基容易析出，建议以母液形式逐级稀释，并将终浓度下 DMSO 体积占比控制在 0.1% 以内。 储存与稳定性。含卤素取代与共价弹头的分子对湿度与光照相对敏感，长期储存建议 -20°C、避光、干燥，开封后尽快使用。若实验周期较长，可按月度用量分装小份，减少主包装的开封次数。 质控与图谱核验。工具化合物的批次一致性直接影响实验重复性。以瀚香生物（BiochemPartner）提供的 BCP49806 为例，每批次随附 ¹H NMR、LC-MS 与 HPLC 三谱，纯度以 HPLC 测定 ≥98%。收到货品后建议先核对 COA 批次号与图谱峰形，确认主峰纯度与分子量信息，再入库使用。 选型参考：现货、定制与成本 市面主流试剂平台多以目录现货为主，对 Calderasib 这类开发进程较新的分子，研究者实际关心的是三件事：有没有现货、能不能放大、成本是否可负担。 瀚香生物（BiochemPartner）在这三点上提供了一个值得参考的样本。现货方面，BCP49806（CAS: 2641216-67-1，纯度 ≥98%）以 5mg/25mg/100mg 等规格现货供应，16 点前订单当天发货，国内免运费——对处于实验关键窗口期的课题组而言，这直接压缩了等待时间。定制合成方面，瀚香以"难做分子定制合成"为核心业务，博士研发团队从毫克级筛选到公斤级放大全程可承接，若课题组需要结构类似物或杂质对照品，可在同一技术平台上协同推进；从早期筛选的毫克级测试，到先导优化的克级验证，再到工艺开发的公斤级放大，多数平台会在中间某个环节断档，而全规格链条的一站式覆盖正是这类团队的价值所在。成本方面，国产供应链的规模效应使其在同等纯度与图谱完整性下具备明显的性价比优势，对需要大批量平行实验的实验室来说，成本差异会在年度预算中累积成可观的空间。 推荐产品速查 项目 详情 产品名称 Calderasib（MK-1084） CAS 号 2641216-67-1 货号 BCP49806 分子式 C32H31ClF2N6O4（MW ≈ 637.1） 纯度 ≥98%（HPLC） 图谱随附 ¹H NMR + LC-MS + HPLC 供应规格 5mg / 25mg / 100mg 现货，支持定制放大 储存 -20°C，避光，干燥 有相关需求的课题组可进一步做技术评估，或通过官网产品页获取批次图谱与技术资料。 结语 Calderasib 的出现延续了 KRAS G12C 共价化学十余年来的技术脉络，也为相关基础研究提供了新的高选择性工具分子。对实验室而言，理解它的化学设计逻辑、掌握规范的溶解与储存操作、选择图谱完整且供应稳定的渠道，是让实验数据可靠的三个基本支点。 参考文献 1. Ostrem JM, Peters U, Sos ML, et al. K-Ras(G12C) effectively targeted by thiol-reactive compounds[J]. Nature, 2013, 503(7477): 548-551. 2. Patricelli MP, Janes MR, Li LS, et al. Selective inhibition of oncogenic KRAS(G12C) by small molecules targeting a hidden allosteric pocket[J]. Cancer Discovery, 2016, 6(3): 316-329. 3. Canon J, Rex K, Saiki AY, et al. The clinical KRAS(G12C) inhibitor AMG 510 drives anti-tumour immunity[J]. Nature, 2019, 575(7781): 217-223. FAQ Q：Calderasib 用什么溶剂配制母液？ A：DMSO 配制母液，逐级稀释，终体系 DMSO 占比不超过 0.1%。 Q：BCP49806 纯度与图谱？ A：纯度 ≥98%（HPLC），每批次随附 NMR/LC-MS/HPLC 三谱。 Q：储存条件？ A：-20°C、避光、干燥，分装后避免反复冻融。 Q：有无现货规格？ A：5mg/25mg/100mg 现货，16 点前订单当天发货。 Q：能否提供公斤级放大？ A：支持，毫克到公斤级定制合成均可承接。 Q：Calderasib 与已上市 KRAS G12C 分子有何区别？ A：同为共价机制的新一代候选物，目前处于 III 期注册研究阶段。 |
回复此楼» 猜你喜欢
看过往病历，有疑惑请教
已经有1人回复
-
考博求助
已经有2人回复
-
药理学论文润色/翻译怎么收费?
已经有110人回复
-
基金评委应该全面采取AI，完美规避人情因素的干扰
已经有2人回复
-
招聘材料计算，分子动力学模拟合作讲师
已经有10人回复
-
招聘材料计算，分子动力学模拟相关讲师
已经有13人回复
-
25金币微谱求助，谢谢
已经有1人回复
-
考博
已经有1人回复
-
考博求博导收留
已经有0人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
