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friya0910

新虫 (正式写手)

[交流] 蛋白质二级结构分析已有9人参与

我有60多条序列,老师要求找出每条序列的螺旋,折叠等的具体位置,然后每条序列出一张图,请问有什么软件可以做到啊,最好是能直接出图的,本人没有接触过生物信息学,一筹莫展,忘高人指点!顺便收一下,我的序列都不长也就100多个氨基酸!以下附上其中一段,都是LTP家族的序列!
maysamtkla lvvalcmvvs vpiaqaitcg qvssnlapci pyvrgggavp paccngirnv
nnlarttpdr qaacnclkql sasvpgvnpn naaalpgkcg vnipyqisps tncanvk
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Arrennew

铁杆木虫 (正式写手)

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
amisking(金币+2): 鼓励应助 2011-05-17 20:04:12
二级结构预测 http://npsa-pbil.ibcp.fr/cgi-bin ... page=npsa_sopm.html
跨膜螺旋分析 http://www.cbs.dtu.dk/services/TMHMM-2.0/
疏水性及跨膜结构分析 http://www.ch.embnet.org/software/TMPRED_form.html

在线工具,很强大,建议收藏,直接出图的,希望对你有用。
生命不息,探索不止。
5楼2011-05-17 17:14:47
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wangzi4ever

金虫 (正式写手)

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
dhd997(金币+2): 热心 2011-05-18 09:04:53
http://www.compbio.dundee.ac.uk/www-jpred/index.html
我一直用这个,速度还挺快,试试吧
8楼2011-05-17 19:24:43
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普通回帖

friya0910

新虫 (正式写手)

自己顶了,我刚查了一下,貌似SOPMA这个软件可以啊,不知谁有这个软件,可否给小女子共享一下啊!
2楼2011-05-17 11:22:49
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yuxia82012

木虫 (著名写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
网页上有在线分析的,你可以用ExPAsy试试
在等待中涅槃重生
3楼2011-05-17 11:32:21
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friya0910

新虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by yuxia82012 at 2011-05-17 11:32:21:
网页上有在线分析的,你可以用ExPAsy试试

这些生物信息学软件实在是太高深了!
4楼2011-05-17 13:08:59
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bio_apai

木虫 (小有名气)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
好东西,跟着学学。
6楼2011-05-17 17:38:15
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happychick

木虫 (著名写手)

学习了.
永远走自己的路,坚持下去
7楼2011-05-17 18:38:57
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friya0910

新虫 (正式写手)

好的,谢谢啊!
9楼2011-05-17 21:26:41
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272401213

木虫 (正式写手)

顶起!
YNWA
10楼2011-05-19 22:55:00
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