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【求助/交流】根据几个测出的氨基酸序列如何进行比对求motif
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shihongling
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[交流]
【求助/交流】根据几个测出的氨基酸序列如何进行比对求motif
已知氨基酸序列,要求比对,求得保守序列motif,详细过程和软件,谢谢。。我用genedoc可以看到相似序列,可是保守的motif怎么求?用什么网站进行分析呢?求详细指导。。
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2011-03-17 15:09:07
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shihongling
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好心人帮帮忙啊!
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2011-03-17 22:02:59
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shihongling
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这么多天了还是没有人啊!
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2011-03-22 09:18:09
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我也想知道,我准备设计一对引物
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2011-03-22 16:00:31
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chasetju
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Originally posted by
shihongling
at 2011-03-17 15:09:07:
已知氨基酸序列,要求比对,求得保守序列motif,详细过程和软件,谢谢。。我用genedoc可以看到相似序列,可是保守的motif怎么求?用什么网站进行分析呢?求详细指导。。
给你如下建议:
1.用其家族基因做Alignment,看保守序列。
2.用prosite在网上搜查数据库中的保守蛋白,肯定能找到对应Motif:
http://www.expasy.org/prosite/
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5楼
2011-03-22 18:09:08
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shihongling
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Originally posted by
chasetju
at 2011-03-22 18:09:08:
给你如下建议:
1.用其家族基因做Alignment,看保守序列。
2.用prosite在网上搜查数据库中的保守蛋白,肯定能找到对应Motif:
http://www.expasy.org/prosite/
我查过了,没有与我的目的蛋白相似的模板,没有已有的三维结构!网站预测不出来……
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6楼
2011-03-23 09:03:11
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