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zengsihai木虫 (小有名气)
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[求助]
测序结果不好的序列能够做系统发育树吗？ 已有2人参与
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各位虫友： 小弟对一株真菌PCR其ITS区，送测序后效果不好，要求是双向测序并且拼接，但是生工告知无法拼接，仅有两条两个方向的测序结果。但是，BLASTN比对有找到相似性，与Fusarium solani相似达99%，可以知道该菌应该是茄镰刀菌了，但是我尝试在NCBI上下载它的一些近似种镰刀菌，拟做一个系统发育树，以期进一步分析它的种属，好提炼一些观点，可是用CLUSTAL X和MEGA6.0，发现待分析序列与下载的已知序列相比，一段一段的，能做出系统发育树吗？ 虫友，象我这种情况，仅有一个方向的序列能够做出系统发育树吗，盼您的指教。 |
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5楼2014-09-11 09:41:43
2楼2014-09-10 22:50:37
zengsihai
木虫 (小有名气)
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- 专业: 植物病理学
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