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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » DNA重组 » 做了nosZ的功能基因，测序结果如下，我应该怎么分析呢？
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swach

铁虫 (小有名气)

[求助] 做了nosZ的功能基因，测序结果如下，我应该怎么分析呢？

各位大侠，如题，测序结果见附件，之前做得16S的，比对之后都是有结果的，可培养的，能知道测序结果的分类地位，这次测出来的都是些不可培养的，我不知道该怎么分析了？我想知道这些测序结果的细菌它们的系统分类地位，应该怎么分析呢？系统发育树要怎么建呢？谢谢！！
1#        Uncultured bacterium clone DaS37 nitrous oxide reductase (nosZ) gene, partial cds                                                               
2#        Uncultured bacterium clone DaS36 nitrous oxide reductase (nosZ) gene, partial cds                                                               
3#        Uncultured bacterium isolate DGGE gel band HZ9D nitrous oxide reductase (nosZ) gene                                                               
4#        Uncultured bacterium clone DaS36 nitrous oxide reductase (nosZ) gene                                                               
5#        Uncultured bacterium clone B42_31 nitrous oxide reductase (nosZ) gene                                                                                                                       
7#        Uncultured bacterium clone DaS36 nitrous oxide reductase (nosZ) gene                                                               
8#        Uncultured bacterium isolate DGGE gel band HZ9D nitrous oxide reductase (nosZ)gene                                                                                                                                       
10#        Uncultured bacterium clone DaS37 nitrous oxide reductase (nosZ) gene                                                               
11#        Uncultured denitrifying bacterium clone 46-nosZ-LZB putative nitrous oxide reductase (nosZ)                                                               
12#        Uncultured bacterium clone DaS36 nitrous oxide reductase (nosZ) gene                                                               
13#        Uncultured bacterium clone Buji5-1 nitrous oxide reductase (nosZ) gene                                                               
14#        Bacillus thuringiensis chiA gene for exochitinase, strain SBS-BT6                                                               
                                                               
16#        Uncultured bacterium clone DaS36 nitrous oxide reductase (nosZ) gene                                                               
17#        Thiobacillus denitrificans ATCC 25259                                                               
18#        Bacterium enrichment culture clone En_UW_15 clone En_UW_15 nitrous-oxide reductase (nosZ) gene                                                               
19#        Bacillus thuringiensis chiA gene for exochitinase, strain SBS-BT6                                                               
20#        Uncultured bacterium clone ISA00218 putative nitrous oxide reductase (nosZ) gene                                                               
21#        Uncultured bacterium clone Buji3-5 nitrous oxide reductase (nosZ) gene                                                               
22#        Uncultured bacterium clone DaS36 nitrous oxide reductase (nosZ) gene
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1楼 2014-09-03 21:26:48
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在雨中

金虫 (著名写手)
我做的nosZ基因大部分也是与非培养的微生物序列接近，这也正常

[ 发自小木虫客户端 ]
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2楼2014-09-04 11:40:37
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swach

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 在雨中 at 2014-09-04 11:40:37
我做的nosZ基因大部分也是与非培养的微生物序列接近，这也正常

我想看看你是怎么分析这些数据的？发育树建了吗？
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3楼2014-09-04 20:03:11
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在雨中

金虫 (著名写手)
★
kx444555: 金币+1, 鼓励交流 2014-09-06 19:15:38
引用回帖:
3楼: Originally posted by swach at 2014-09-04 20:03:11
我想看看你是怎么分析这些数据的？发育树建了吗？...

基因组成肯定要建树的

[ 发自小木虫客户端 ]
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4楼2014-09-05 10:25:25
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swach

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 在雨中 at 2014-09-05 10:25:25
基因组成肯定要建树的
...

我知道，我是想想你请教下，因为我是第一次做，不太懂。你能私下教教我吗？很着急，谢谢
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5楼2014-09-06 16:32:33
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在雨中

金虫 (著名写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by swach at 2014-09-06 16:32:33
我知道，我是想想你请教下，因为我是第一次做，不太懂。你能私下教教我吗？很着急，谢谢...

我刚建了个树，没别的本事，怎么指导您呀

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6楼2014-09-06 23:55:57
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swach

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by 在雨中 at 2014-09-06 23:55:57
我刚建了个树，没别的本事，怎么指导您呀
...

你好，我想请问你建树选择的外群是哪些呢？

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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7楼2014-09-23 10:08:55
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袁慧兰199047

新虫 (初入文坛)
我也在做nosZ基因克隆，但是还没拿到序列，请问你是通过什么方法克隆的？求指导
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8楼2014-10-30 11:09:13
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