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swach铁虫 (小有名气)
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做了nosZ的功能基因，测序结果如下，我应该怎么分析呢？
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各位大侠，如题，测序结果见附件，之前做得16S的，比对之后都是有结果的，可培养的，能知道测序结果的分类地位，这次测出来的都是些不可培养的，我不知道该怎么分析了？我想知道这些测序结果的细菌它们的系统分类地位，应该怎么分析呢？系统发育树要怎么建呢？谢谢！！ 1# Uncultured bacterium clone DaS37 nitrous oxide reductase (nosZ) gene, partial cds 2# Uncultured bacterium clone DaS36 nitrous oxide reductase (nosZ) gene, partial cds 3# Uncultured bacterium isolate DGGE gel band HZ9D nitrous oxide reductase (nosZ) gene 4# Uncultured bacterium clone DaS36 nitrous oxide reductase (nosZ) gene 5# Uncultured bacterium clone B42_31 nitrous oxide reductase (nosZ) gene 7# Uncultured bacterium clone DaS36 nitrous oxide reductase (nosZ) gene 8# Uncultured bacterium isolate DGGE gel band HZ9D nitrous oxide reductase (nosZ)gene 10# Uncultured bacterium clone DaS37 nitrous oxide reductase (nosZ) gene 11# Uncultured denitrifying bacterium clone 46-nosZ-LZB putative nitrous oxide reductase (nosZ) 12# Uncultured bacterium clone DaS36 nitrous oxide reductase (nosZ) gene 13# Uncultured bacterium clone Buji5-1 nitrous oxide reductase (nosZ) gene 14# Bacillus thuringiensis chiA gene for exochitinase, strain SBS-BT6 16# Uncultured bacterium clone DaS36 nitrous oxide reductase (nosZ) gene 17# Thiobacillus denitrificans ATCC 25259 18# Bacterium enrichment culture clone En_UW_15 clone En_UW_15 nitrous-oxide reductase (nosZ) gene 19# Bacillus thuringiensis chiA gene for exochitinase, strain SBS-BT6 20# Uncultured bacterium clone ISA00218 putative nitrous oxide reductase (nosZ) gene 21# Uncultured bacterium clone Buji3-5 nitrous oxide reductase (nosZ) gene 22# Uncultured bacterium clone DaS36 nitrous oxide reductase (nosZ) gene |
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