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sharon318318

新虫 (初入文坛)

[交流] 请教，有转录组高通量测序的得到的差异表达基因，筛选几个基因出来进行功能鉴定 已有9人参与

之前的师兄做了棉铃虫转录组高通量测序，得到一些差异表达基因，老师说让我接着他那个往下做，让我再那些差异基因里边筛选几个有价值的基因出来进行功能研究，由于我是转专业过来的，对这个也不太懂，不知道怎样下手才能晒训出老师所说的有价值的基因，对于这种差异基因要从哪些方面进行比较和筛选呢？请高手指点。
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1楼 2014-01-12 20:32:29
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woody196

木虫 (著名写手)
★
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我只能说只是一项比较 庞大的工作，转录组一下找出的差异基因就有成千上万，你得自己去验证这些基因，楼主加油吧！！
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2楼2014-01-12 20:38:57
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洛基殿下~

捐助贵宾 (小有名气)
商家已经主动声明此回帖可能含有宣传内容
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
你可以到测序中国上面去问下，那边是专门的测序论坛
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3楼2014-01-14 11:24:59
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laojiu9878

至尊木虫 (知名作家)

九牛
先确定哪方面的 再筛查基因
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但愿人长久
4楼2014-01-15 12:52:20
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清新百合3

金虫 (正式写手)
★
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我最近也在做转录组方面的，最后和你的一样，也是需要通过得到有价值的差异基因进行功能验证。
    关于差异基因，首先要明白你需要做哪方面的差异基因的筛选，你提到你研究的是棉铃虫，那么你是研究棉铃虫的哪种功能，是它的抗性还是其他别的什么生理功能。测序公司给你差异基因的时候应该会把最后差异基因进行GO富集和KEGG富集，最后得到Pathway maps。

    呵呵，我们以后可以交流一下啊。。
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心如止水
5楼2014-03-06 10:19:06
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liuzhen2008

捐助贵宾 (初入文坛)
★
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楼上的战友们，你们在为大量样本，多个基因验证头疼吗？
给你们推荐一个新技术，适合大量样本，多个基因的表达量分析，介绍帖子：http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=7185248#robot  
这个方法适合数百个到几千个样本，几十个几百个基因表达量分析。
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6楼2014-03-28 11:59:43
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无敌小辣姣

新虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
楼主现在做的怎么样了，我现在开始做这个，可否指点下？
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7楼2014-11-28 14:18:44
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七大姑八大姨

新虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
5楼: Originally posted by 清新百合3 at 2014-03-06 10:19:06
我最近也在做转录组方面的，最后和你的一样，也是需要通过得到有价值的差异基因进行功能验证。
    关于差异基因，首先要明白你需要做哪方面的差异基因的筛选，你提到你研究的是棉铃虫，那么你是研究棉铃虫的哪种功 ...

我也在处理转录组数据，测的是龙眼种子，一起交流！
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8楼2015-04-16 22:51:02
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真高兴

新虫 (初入文坛)
★
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请问，确定了差异基因，如何进行功能验证啊，通过什么手段呀？
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9楼2015-05-10 19:52:46
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xie859625

新虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
转录组科研交流 477391418 刚刚开始做这方面  希望和大家交流 并给之后做的朋友一个转录组交流的平台
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10楼2015-08-18 16:41:47
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