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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 转录组测序 可行性
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yc_diudiu

铁虫 (初入文坛)

[求助] 转录组测序 可行性

各位大侠，我要做一种植物的转录组测序，但是它既没有基因组测序，在NCBI中也没有EST序列，有人说这样以来我即使做了转录组测序，后期数据也没有什么意义的，真是这样吗？还能分析找到新基因什么的吗？谢谢了
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1楼 2012-07-10 09:54:53
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

shenye.judy

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
小丹木木: 金币+2, 鼓励应助 2012-07-10 13:46:52
yc_diudiu: 金币+1, ★有帮助, 谢谢你 2012-07-12 11:18:34
从基因组时代开始，每一个物种，都是从有一些数据---------到数据丰富的过程，所以不能说完全没有意义。
但由于相关序列信息少，对你们以后的研究，发展，发表论文之类的，会有局限性。
你主要看看，你测的物种，其同源物种有没有被相关的数据，是可以作为序列注释的参考的！
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2楼2012-07-10 11:01:15
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lyqifeih

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by shenye.judy at 2012-07-10 11:01:15
从基因组时代开始，每一个物种，都是从有一些数据---------到数据丰富的过程，所以不能说完全没有意义。
但由于相关序列信息少，对你们以后的研究，发展，发表论文之类的，会有局限性。
你主要看看，你测的物种， ...

赞同2楼讲的，对以后的物种及其变异分析有帮助！我自己做测序，我分析STR。
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刚进入神经生物和电生理
3楼2012-07-10 11:05:56
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普通回帖

yc_diudiu

铁虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by shenye.judy at 2012-07-10 11:01:15
从基因组时代开始，每一个物种，都是从有一些数据---------到数据丰富的过程，所以不能说完全没有意义。
但由于相关序列信息少，对你们以后的研究，发展，发表论文之类的，会有局限性。
你主要看看，你测的物种， ...

谢谢您，我做的是蔷薇科李属的一种梅子，该属种桃的基因组已经测序了，不知道能不能利用呢？
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4楼2012-07-10 15:00:17
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yc_diudiu

铁虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by lyqifeih at 2012-07-10 11:05:56
赞同2楼讲的，对以后的物种及其变异分析有帮助！我自己做测序，我分析STR。...

谢谢了
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5楼2012-07-10 15:00:43
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shenye.judy

木虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by yc_diudiu at 2012-07-10 15:00:17
谢谢您，我做的是蔷薇科李属的一种梅子，该属种桃的基因组已经测序了，不知道能不能利用呢？...

是可以做参考的，主要是在基因注释上。
毕竟不同物种，基因序列，基因组信息肯定是有差异的。
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6楼2012-07-11 10:59:37
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yc_diudiu

铁虫 (初入文坛)
引用回帖:
6楼: Originally posted by shenye.judy at 2012-07-11 10:59:37
是可以做参考的，主要是在基因注释上。
毕竟不同物种，基因序列，基因组信息肯定是有差异的。...

谢谢您
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7楼2012-07-12 09:36:18
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robertorun

金虫 (正式写手)
相应的资源少，说明你做的更有意义！
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8楼2012-07-13 09:55:04
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yc_diudiu

铁虫 (初入文坛)
引用回帖:
8楼: Originally posted by robertorun at 2012-07-13 09:55:04
相应的资源少，说明你做的更有意义！

难度好大呀，谢谢你的鼓励
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9楼2012-07-13 20:42:58
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crab922

新虫 (初入文坛)
遇到这种情况，后续的生物信息分析真不知该怎么办。
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10楼2012-11-22 21:58:54
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