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yc_diudiu

铁虫 (初入文坛)

[求助] 转录组测序 可行性

各位大侠,我要做一种植物的转录组测序,但是它既没有基因组测序,在NCBI中也没有EST序列,有人说这样以来我即使做了转录组测序,后期数据也没有什么意义的,真是这样吗?还能分析找到新基因什么的吗?谢谢了
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shenye.judy

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
小丹木木: 金币+2, 鼓励应助 2012-07-10 13:46:52
yc_diudiu: 金币+1, 有帮助, 谢谢你 2012-07-12 11:18:34
从基因组时代开始,每一个物种,都是从有一些数据---------到数据丰富的过程,所以不能说完全没有意义。
但由于相关序列信息少,对你们以后的研究,发展,发表论文之类的,会有局限性。
你主要看看,你测的物种,其同源物种有没有被相关的数据,是可以作为序列注释的参考的!
2楼2012-07-10 11:01:15
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lyqifeih

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by shenye.judy at 2012-07-10 11:01:15
从基因组时代开始,每一个物种,都是从有一些数据---------到数据丰富的过程,所以不能说完全没有意义。
但由于相关序列信息少,对你们以后的研究,发展,发表论文之类的,会有局限性。
你主要看看,你测的物种, ...

赞同2楼讲的,对以后的物种及其变异分析有帮助!我自己做测序,我分析STR。
刚进入神经生物和电生理
3楼2012-07-10 11:05:56
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yc_diudiu

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by shenye.judy at 2012-07-10 11:01:15
从基因组时代开始,每一个物种,都是从有一些数据---------到数据丰富的过程,所以不能说完全没有意义。
但由于相关序列信息少,对你们以后的研究,发展,发表论文之类的,会有局限性。
你主要看看,你测的物种, ...

谢谢您,我做的是蔷薇科李属的一种梅子,该属种桃的基因组已经测序了,不知道能不能利用呢?
4楼2012-07-10 15:00:17
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yc_diudiu

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by lyqifeih at 2012-07-10 11:05:56
赞同2楼讲的,对以后的物种及其变异分析有帮助!我自己做测序,我分析STR。...

谢谢了
5楼2012-07-10 15:00:43
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shenye.judy

木虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by yc_diudiu at 2012-07-10 15:00:17
谢谢您,我做的是蔷薇科李属的一种梅子,该属种桃的基因组已经测序了,不知道能不能利用呢?...

是可以做参考的,主要是在基因注释上。
毕竟不同物种,基因序列,基因组信息肯定是有差异的。
6楼2012-07-11 10:59:37
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yc_diudiu

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
6楼: Originally posted by shenye.judy at 2012-07-11 10:59:37
是可以做参考的,主要是在基因注释上。
毕竟不同物种,基因序列,基因组信息肯定是有差异的。...

谢谢您
7楼2012-07-12 09:36:18
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robertorun

金虫 (正式写手)

相应的资源少,说明你做的更有意义!
8楼2012-07-13 09:55:04
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yc_diudiu

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
8楼: Originally posted by robertorun at 2012-07-13 09:55:04
相应的资源少,说明你做的更有意义!

难度好大呀,谢谢你的鼓励
9楼2012-07-13 20:42:58
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crab922

新虫 (初入文坛)

遇到这种情况,后续的生物信息分析真不知该怎么办。
10楼2012-11-22 21:58:54
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