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转录组测序 可行性
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yc_diudiu
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转录组测序 可行性
各位大侠,我要做一种植物的转录组测序,但是它既没有基因组测序,在NCBI中也没有EST序列,有人说这样以来我即使做了转录组测序,后期数据也没有什么意义的,真是这样吗?还能分析找到新基因什么的吗?
谢谢了
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1楼
2012-07-10 09:54:53
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2012-07-10 13:46:52
yc_diudiu: 金币+1,
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有帮助, 谢谢你
2012-07-12 11:18:34
从基因组时代开始,每一个物种,都是从有一些数据---------到数据丰富的过程,所以不能说完全没有意义。
但由于相关序列信息少,对你们以后的研究,发展,发表论文之类的,会有局限性。
你主要看看,你测的物种,其同源物种有没有被相关的数据,是可以作为序列注释的参考的!
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2楼
2012-07-10 11:01:15
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2楼
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shenye.judy
at 2012-07-10 11:01:15
从基因组时代开始,每一个物种,都是从有一些数据---------到数据丰富的过程,所以不能说完全没有意义。
但由于相关序列信息少,对你们以后的研究,发展,发表论文之类的,会有局限性。
你主要看看,你测的物种, ...
赞同2楼讲的,对以后的物种及其变异分析有帮助!我自己做测序,我分析STR。
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刚进入神经生物和电生理
3楼
2012-07-10 11:05:56
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yc_diudiu
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2楼
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shenye.judy
at 2012-07-10 11:01:15
从基因组时代开始,每一个物种,都是从有一些数据---------到数据丰富的过程,所以不能说完全没有意义。
但由于相关序列信息少,对你们以后的研究,发展,发表论文之类的,会有局限性。
你主要看看,你测的物种, ...
谢谢您,我做的是蔷薇科李属的一种梅子,该属种桃的基因组已经测序了,不知道能不能利用呢?
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4楼
2012-07-10 15:00:17
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lyqifeih
at 2012-07-10 11:05:56
赞同2楼讲的,对以后的物种及其变异分析有帮助!我自己做测序,我分析STR。...
谢谢了
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5楼
2012-07-10 15:00:43
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yc_diudiu
at 2012-07-10 15:00:17
谢谢您,我做的是蔷薇科李属的一种梅子,该属种桃的基因组已经测序了,不知道能不能利用呢?...
是可以做参考的,主要是在基因注释上。
毕竟不同物种,基因序列,基因组信息肯定是有差异的。
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6楼
2012-07-11 10:59:37
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shenye.judy
at 2012-07-11 10:59:37
是可以做参考的,主要是在基因注释上。
毕竟不同物种,基因序列,基因组信息肯定是有差异的。...
谢谢您
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7楼
2012-07-12 09:36:18
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相应的资源少,说明你做的更有意义!
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yc_diudiu
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robertorun
at 2012-07-13 09:55:04
相应的资源少,说明你做的更有意义!
难度好大呀,谢谢你的鼓励
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9楼
2012-07-13 20:42:58
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crab922
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遇到这种情况,后续的生物信息分析真不知该怎么办。
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10楼
2012-11-22 21:58:54
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