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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 抗寒胁迫下，做转录组测序的取样部位问题。
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jiangliangba

铁虫 (初入文坛)

[求助] 抗寒胁迫下，做转录组测序的取样部位问题。

试验材料是北方木本植物，叶子都落光啦，就不指望用叶片取样了。然后现在有两个选择：1是取一年生枝的韧皮部，2是取1年生枝的花芽。
试验目的是看低温驯化过程中表达谱的变化。不知道提总RNA的话结合我的试验目的，取哪部分做样品合适啊？
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1楼 2012-03-06 22:20:57
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ZOEY21

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
西瓜(金币+2): 鼓励交流 2012-03-07 12:16:24
是不是还要结合你实验材料的生物学特性 我第一个反应是用花芽做 然后想了想你的试验花芽的话是否有受到寒冷胁迫的可能 同一植株不同器官表达谱可能也不同 所以也许你两种都做 能看到差异
我不太懂qrtPCR，只是之前想做了解了下初级内容，所以不当之处，请指教
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2楼2012-03-07 08:30:47
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wanhscn

木虫 (职业作家)

哲学@草根

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
在没有确切的答案的情况下，建议楼主两个都取，属于不同组织！
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真相是最大的奢侈品
3楼2012-03-07 14:16:40
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lanjb1013

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
常绿树种建议叶子，落叶树种建议花芽，我也准备做这方面的工作，多交流！
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4楼2012-04-25 00:11:41
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fangqun

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
取花芽吧。如果花芽受到低温冻害，第二年就会没有收获。我也想做这方面的工作，多交流。
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5楼2012-04-25 09:03:50
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fangqun

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

并且花芽的绽放即bud flushing主要是受积温的影响。这样对抗寒胁迫的研究有意义。
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6楼2012-04-25 09:06:07
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yc_diudiu

铁虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

我觉得还是取韧皮部吧，芽一般受积温影响，一定时间的低温对它来说可能不足以称之为胁迫的
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7楼2012-07-10 09:59:03
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