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sharon318318

新虫 (初入文坛)

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[交流] 请教，有转录组高通量测序的得到的差异表达基因，筛选几个基因出来进行功能鉴定已有9人参与

之前的师兄做了棉铃虫转录组高通量测序，得到一些差异表达基因，老师说让我接着他那个往下做，让我再那些差异基因里边筛选几个有价值的基因出来进行功能研究，由于我是转专业过来的，对这个也不太懂，不知道怎样下手才能晒训出老师所说的有价值的基因，对于这种差异基因要从哪些方面进行比较和筛选呢？请高手指点。

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1楼 2014-01-12 20:32:29

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清新百合3

金虫 (正式写手)

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专业: 植物生理与生化

★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖

我最近也在做转录组方面的，最后和你的一样，也是需要通过得到有价值的差异基因进行功能验证。
关于差异基因，首先要明白你需要做哪方面的差异基因的筛选，你提到你研究的是棉铃虫，那么你是研究棉铃虫的哪种功能，是它的抗性还是其他别的什么生理功能。测序公司给你差异基因的时候应该会把最后差异基因进行GO富集和KEGG富集，最后得到Pathway maps。

呵呵，我们以后可以交流一下啊。。