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sharon318318

新虫 (初入文坛)

[交流] 请教,有转录组高通量测序的得到的差异表达基因,筛选几个基因出来进行功能鉴定 已有9人参与

之前的师兄做了棉铃虫转录组高通量测序,得到一些差异表达基因,老师说让我接着他那个往下做,让我再那些差异基因里边筛选几个有价值的基因出来进行功能研究,由于我是转专业过来的,对这个也不太懂,不知道怎样下手才能晒训出老师所说的有价值的基因,对于这种差异基因要从哪些方面进行比较和筛选呢?请高手指点。
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清新百合3

金虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
我最近也在做转录组方面的,最后和你的一样,也是需要通过得到有价值的差异基因进行功能验证。
    关于差异基因,首先要明白你需要做哪方面的差异基因的筛选,你提到你研究的是棉铃虫,那么你是研究棉铃虫的哪种功能,是它的抗性还是其他别的什么生理功能。测序公司给你差异基因的时候应该会把最后差异基因进行GO富集和KEGG富集,最后得到Pathway maps。

    呵呵,我们以后可以交流一下啊。。
心如止水
5楼2014-03-06 10:19:06
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woody196

木虫 (著名写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
我只能说只是一项比较 庞大的工作,转录组一下找出的差异基因就有成千上万,你得自己去验证这些基因,楼主加油吧!!
2楼2014-01-12 20:38:57
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洛基殿下~

捐助贵宾 (小有名气)


商家已经主动声明此回帖可能含有宣传内容

小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
你可以到测序中国上面去问下,那边是专门的测序论坛
3楼2014-01-14 11:24:59
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laojiu9878

至尊木虫 (文坛精英)

九牛

先确定哪方面的 再筛查基因
但愿人长久
4楼2014-01-15 12:52:20
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