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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 细胞科学 » 求助大牛，全基因组测序问题
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青鸟1901

铁虫 (小有名气)

[交流] 求助大牛，全基因组测序问题 已有1人参与

本人菜鸟一枚，近期打算做一些实验，本来是想做转录组测序看信号通路等，现在是能够做全基因组测序，想知道人胚胎干细胞的全基因组测序能够得到什么相关内容啊，求助，十分感谢！
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你若盛开，清风自来
1楼 2014-04-16 19:56:07
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青鸟1901

铁虫 (小有名气)
十分感谢，会仔细看看
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你若盛开，清风自来
2楼2014-04-17 11:46:14
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凌波丽

专家顾问 (知名作家)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
你是想问二代测序技术？还是功能基因组学？。。。
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3楼2014-04-26 20:14:56
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凌波丽

专家顾问 (知名作家)
还是希望我帮你设计出从转本组水平研究细胞信号调控的实验方案?
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4楼2014-04-26 20:16:34
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青鸟1901

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 凌波丽 at 2014-04-26 20:16:34
还是希望我帮你设计出从转本组水平研究细胞信号调控的实验方案?

主要是想根据转录组水平看信号通路
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你若盛开，清风自来
5楼2014-04-26 20:52:22
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凌波丽

专家顾问 (知名作家)
可深入的角度太多了，你能不能说的具体些，对于你的课题的要求。
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6楼2014-04-26 20:56:55
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青鸟1901

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by 凌波丽 at 2014-04-26 20:56:55
可深入的角度太多了，你能不能说的具体些，对于你的课题的要求。

本人方向人胚胎干细胞，本来想寻找诱导分化过程中的信号通路调控，阅读文献觉得内容太多可靠性不详，准备在不同阶段获取细胞RNA行转录组测序，看变化差异，谢谢
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你若盛开，清风自来
7楼2014-04-27 10:05:51
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凌波丽

专家顾问 (知名作家)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
有条件可以做gene expression profile，我个人认为如果诱导分化过程中的信号通路调控的深入角度很多，gene expression profile是一个方面，准备在不同阶段获取细胞RNA行转录组测序也可以，但是转录本组距离蛋白质组与具体的细胞信号网络之间的间距还是足够大的，我感觉如果如楼所言可能工作量过大，除非你已经知道了某种信号通路的组成的蛋白质成员的基因和它们的作用位点。
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8楼2014-04-27 10:15:24
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凌波丽

专家顾问 (知名作家)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
如果从蛋白质角度去建立具体的信号通路或者构建某种范围的信号传导网络，也有很多的实验和生物信息学方法可以选择。

我们可依据你的实验要求具体在讨论。
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9楼2014-04-27 10:18:09
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