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syx1983

金虫 (正式写手)


[交流] 【求助/交流】抗病基因克隆或定位

有一个小麦品种和其近等系,近等系有抗叶锈病的性状,如何克隆或定位这个抗病基因?请详细介绍方法及原理
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zhangxn2010

木虫 (著名写手)


★ ★
syx1983(金币+2):谢谢参与
dhd997(金币+1): 鼓励交流 2011-01-19 09:43:22
肯定是提RNA,然后southern之类的;你可以查阅耐盐基因克隆等
2楼2011-01-19 08:14:18
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香菱儿

铁杆木虫 (著名写手)



syx1983(金币+2):谢谢参与
QTL mapping
3楼2011-01-19 09:50:33
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skkyy88888

铜虫 (著名写手)



syx1983(金币+2):谢谢参与
抑制消减杂交方法筛吧。
4楼2011-01-19 11:11:57
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syx1983

金虫 (正式写手)


大家的方法貌似不够给力,太简化了。
5楼2011-01-19 21:05:52
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haitian0625

金虫 (小有名气)



syx1983(金币+2):谢谢参与
利用SSR、SNP等位标进行初步定位、精细定位。
6楼2011-01-19 22:07:43
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amilie030312

金虫 (正式写手)


有一本书叫分子克隆
7楼2011-01-19 22:46:35
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Morus

金虫 (小有名气)



小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
既然有近等系,当然是用QTL定位这个基因了。建议关注一下如何用QTL技术将基因克隆出来
8楼2011-01-21 16:05:36
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翱宇

禁虫 (正式写手)



小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
有近亲植物,那就找到近亲植物的该同源基因的序列,假如你做小麦,则这个基因肯定没有序列吧。以近亲植物的同源基因设计引物,提取小麦的RNA,以OlogodT去扩增看能扩出来不,注意退火温度要很低。

假如运气好,扩增出来了,测序验证读码框和翻译的蛋白质。可以做亚克隆连入至GFP,在洋葱表皮等做细胞定位。
9楼2011-01-21 16:42:00
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newmillet

金虫 (初入文坛)



小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
小麦的基因组很大,有16G,且组配群体耗时过长,一般不推荐采用图位克隆。采用同源克隆或是混池鉴定也许是比较优先的尝试
10楼2011-02-12 15:20:08
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科学之家

新虫 (正式写手)


抗病基因克隆


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
抗条锈病基因已经有大量研究。根据已经有的信息,判断是新基因,还是已有基因。先做基因定位,最好是“基因组扫描”,如果是课题基础较好,能判断候选基因,进而采取合适的基因克隆方法。可讨论,发邮件:mgfree06@163.com
11楼2011-02-13 11:18:52
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小路2011

铁虫 (初入文坛)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
小麦应该测序了吧,普通方法应该就是找到全基因组的分子标记,全基因组扫描,先对该该性状进行初定位,大概确定它的主效位点在几号染色体上,然后再开发新的标记,扩大群体精细定位,该方法工作量很大。还有比较新的方法就是取抗病池和易感池测序,但该方法人类上用的多,植物上少,不知道效果怎样!大家同是战友,一起加油吧!
12楼2013-01-08 16:52:36
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