应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 实验/技术 » 细菌全基因组测序
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
61/1返回列表
查看: 2049  |  回复: 5
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

dazhen9527

新虫 (小有名气)

[求助] 细菌全基因组测序

现有一质粒整合到细菌基因组，想通过测序的方法知道整合的位点，细菌的基因组序列是未知的但知道与它同源性99%的同一物种的基因组序列，请问通过什么测序方法可以得到整合位点，基因组冲测序可以吗，每种测序的价钱请详解，谢谢！
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
justdoit
1楼 2013-08-04 13:39:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

小小亚杰

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
amisking: 金币+2, 感谢发帖应助，帮助虫子 2013-08-04 22:02:00
dazhen9527: 金币+5, ★有帮助 2013-08-07 19:39:11
你做实验的整合质粒难道别人没有研究过么？
除非是你自己构造的整合质粒，不然已知的质粒早都有文献报告过了，不需要自己测序去找位点吧？
或者你用质粒上的引物往两边扩增一下就知道大概的位置了吧。
赞一下 回复此楼
2楼2013-08-04 20:46:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dazhen9527

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 小小亚杰 at 2013-08-04 20:46:07
你做实验的整合质粒难道别人没有研究过么？
除非是你自己构造的整合质粒，不然已知的质粒早都有文献报告过了，不需要自己测序去找位点吧？
或者你用质粒上的引物往两边扩增一下就知道大概的位置了吧。

质粒序列已知，但是断开位点位点，质粒串联数目未知，反向PCR不好找呀
赞一下 回复此楼
justdoit
3楼2013-08-06 15:26:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lyjxp1987

木虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
dazhen9527: 金币+5, ★有帮助 2013-08-07 19:39:01
1楼反向PCR的方法可行，质粒上的整合位点是固定的，可以查一下序列，是哪种整合位点，确定后在两端设计引物进行反向PCR，整合质粒一般只有一个拷贝，可以先做一下试试，没必要全基因测序。
赞一下 回复此楼
4楼2013-08-06 15:48:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dazhen9527

新虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by lyjxp1987 at 2013-08-06 15:48:17
1楼反向PCR的方法可行，质粒上的整合位点是固定的，可以查一下序列，是哪种整合位点，确定后在两端设计引物进行反向PCR，整合质粒一般只有一个拷贝，可以先做一下试试，没必要全基因测序。

现在发现质粒有可能是串联后串联的，一般是整合到一个地方，但是现在的情况是有可能出线了多位点整合，如果是质粒的串联了，这会对反向PCR有一定的影响！！
赞一下 回复此楼
justdoit
5楼2013-08-07 19:41:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

小小亚杰

木虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by dazhen9527 at 2013-08-06 15:26:09
质粒序列已知，但是断开位点位点，质粒串联数目未知，反向PCR不好找呀...

没遇到过这样的情况，帮不了你了额。
赞一下 回复此楼
6楼2013-08-07 22:34:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 dazhen9527 的主题更新
61/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 材料专硕(0856) 339分求调剂 +9 哈哈哈鹅哈哈哈 2026-04-04 9/450 2026-04-05 13:09 by gaoxiaoniuma
[考研] 一志愿南航，数一英一学硕317求调剂！！ +5 Acaciad 2026-04-04 5/250 2026-04-05 12:31 by 搏击518
[考研] 288求调剂，一志愿华南理工大学071005 +6 ioodiiij 2026-04-04 6/300 2026-04-05 10:09 by guoweigw
[考研] 一志愿北京2，材料与化工308求调剂 +10 熊二想上岸 2026-04-04 10/500 2026-04-05 05:20 by houyaoxu
[考研] 309分085801求调剂 +11 MY_angel 2026-03-31 11/550 2026-04-04 19:11 by 蓝云思雨
[考研] 333求调剂 +9 阿科逸 2026-03-31 9/450 2026-04-04 18:25 by macy2011
[考研] 22408求调剂 354分 可跨专业 +3 hannnnnnn 2026-04-04 3/150 2026-04-04 14:35 by 土木硕士招生
[考研] 305求调剂 +3 77Qi 2026-04-03 3/150 2026-04-03 23:01 by qzxyhcsy
[考研] 化工调剂303分，过四级 +28 栖梧待风 2026-04-02 28/1400 2026-04-03 21:40 by qlm5820
[考研] 327求调剂 +9 小卡不卡. 2026-03-29 9/450 2026-04-03 19:48 by 百灵童888
[考研] 071000生物学调剂 +8 知昭蔓 2026-04-02 8/400 2026-04-03 10:36 by macy2011
[考研] 材料考研调剂 +10 Gs大王 2026-04-02 10/500 2026-04-03 09:47 by 遗忘消失的灆
[考研] 312 化工或制药调剂 +8 小小墨123 2026-04-02 9/450 2026-04-03 09:12 by zhouxiaoyu
[考研] 土木304求调剂 +6 兔突突突， 2026-03-31 7/350 2026-04-02 09:06 by coolminer
[考研] 307分求调剂 +14 (o~o) 2026-03-31 15/750 2026-04-01 20:43 by longlotian
[考研] 070300化学专业279调剂 +10 哈哈哈^_^ 2026-03-31 10/500 2026-03-31 23:13 by liu823948201
[考研] 英一数一总分334求调剂 +4 陈阳坤 2026-03-31 4/200 2026-03-31 14:22 by 记事本2026
[考研] 一志愿西电085401数一英一299求调剂 六级521 +4 爱吃大鸭梨 2026-03-31 4/200 2026-03-31 11:51 by 搏击518
[考研] 本科211总分289，08工学真心求调剂 +3 utopiaE 2026-03-30 3/150 2026-03-30 23:42 by ms629
[考研] 调剂 +4 GK72 2026-03-30 4/200 2026-03-30 20:32 by dick_runner
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭