[求助] 请教拟南芥基因组重测序问题

最近计划进行一份突变体样品的拟南芥基因组重测序，不知是否有XDJM做过类似工作，需要准备多少个单株的样品？测序深度是多少？测序周期？万分感谢！

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1楼2013-08-21 20:56:48

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拟南芥（Arabidopsis thaliana）是一种十字花科植物，在分子遗传学、植物学以及农业科学的研究中发挥了重要的作用，是重要的模式生物，种群间有不同的遗传差异。
Patterns of population epigenomic diversity.中研究人员从北半球各地收集了基因型不同的野生拟南芥，进行了详细的群体水平分析。他们对217株植物进行了全基因组DNA测序，其中152株进行了全基因组甲基化图谱分析，144株进行了基因转录图谱分析。
不知现在的Pacbio测序平台是否可以在拟南芥研究方面有所应用

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5楼2014-01-19 10:54:43

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