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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 请教拟南芥基因组重测序问题
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lifeutopia

铜虫 (初入文坛)

[求助] 请教拟南芥基因组重测序问题

最近计划进行一份突变体样品的拟南芥基因组重测序，不知是否有XDJM做过类似工作，需要准备多少个单株的样品？测序深度是多少？测序周期？万分感谢！
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1楼 2013-08-21 20:56:48
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bired

木虫 (著名写手)
同来关注。
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2楼2013-08-21 22:05:15
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xudabin98

木虫 (正式写手)
gyesang: 屏蔽内容, 违规存档, 广告！ 2013-10-01 17:05:49
本帖内容被屏蔽
3楼2013-10-01 10:56:24
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xudabin98

木虫 (正式写手)
gyesang: 屏蔽内容, 违规存档, 广告！ 2013-10-01 17:06:00
本帖内容被屏蔽
4楼2013-10-01 10:56:33
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想飞的fish

新虫 (小有名气)
拟南芥（Arabidopsis thaliana）是一种十字花科植物，在分子遗传学、植物学以及农业科学的研究中发挥了重要的作用，是重要的模式生物，种群间有不同的遗传差异。
Patterns of population epigenomic diversity.中  研究人员从北半球各地收集了基因型不同的野生拟南芥，进行了详细的群体水平分析。他们对217株植物进行了全基因组DNA测序，其中152株进行了全基因组甲基化图谱分析，144株进行了基因转录图谱分析。
不知现在的Pacbio测序平台是否可以在拟南芥研究方面有所应用
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5楼2014-01-19 10:54:43
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