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lifeutopia

铜虫 (初入文坛)

[求助] 请教拟南芥基因组重测序问题

最近计划进行一份突变体样品的拟南芥基因组重测序,不知是否有XDJM做过类似工作,需要准备多少个单株的样品?测序深度是多少?测序周期?万分感谢!
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bired

木虫 (著名写手)

同来关注。
2楼2013-08-21 22:05:15
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xudabin98

木虫 (正式写手)

gyesang: 屏蔽内容, 违规存档, 广告! 2013-10-01 17:05:49
本帖内容被屏蔽

3楼2013-10-01 10:56:24
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xudabin98

木虫 (正式写手)

gyesang: 屏蔽内容, 违规存档, 广告! 2013-10-01 17:06:00
本帖内容被屏蔽

4楼2013-10-01 10:56:33
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想飞的fish

新虫 (小有名气)


拟南芥(Arabidopsis thaliana)是一种十字花科植物,在分子遗传学、植物学以及农业科学的研究中发挥了重要的作用,是重要的模式生物,种群间有不同的遗传差异。
Patterns of population epigenomic diversity.中  研究人员从北半球各地收集了基因型不同的野生拟南芥,进行了详细的群体水平分析。他们对217株植物进行了全基因组DNA测序,其中152株进行了全基因组甲基化图谱分析,144株进行了基因转录图谱分析。
不知现在的Pacbio测序平台是否可以在拟南芥研究方面有所应用
5楼2014-01-19 10:54:43
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