| 查看: 2219 | 回复: 7 | ||
小木虫刘树青木虫 (著名写手)
夜未眠
|
[求助]
测序结果与NCBI有差别，求解释！ 已有2人参与
|
 测序结果与NCBI有差别，求解释！我现在P的是RNA的CDS序列，我引物设计正好是全长CDS，过程是先提RNA再反转cDNA，以cDNA为模板进行PCR，P出来后，胶回收，19T连接，转染，测序。 现在的问题是：NCBI上这段CDS序列长度为2019bp，可是测序结果却是2116BP，多了将近100bp，两端我也进行了Blast比对，结果相似度99%。我现在不知道这是为什么？ 我直接让测序公司拼接的，多的序列在测序结果的93-183，另外在其他部位还有多1-2个碱基的现象，只有几处，但是93-183这段不知道是什么？ 求高人解释 [ Last edited by 小木虫刘树青 on 2014-1-27 at 19:58 ] |
回复此楼» 猜你喜欢
0817 化学工程 299分求调剂 有科研经历 有二区文章
已经有17人回复
-
一志愿武汉理工材料工程专硕调剂
已经有5人回复
-
0856调剂，是学校就去
已经有7人回复
-
申博26年
已经有3人回复
-
一志愿吉林大学材料学硕321求调剂
已经有10人回复
-
0703化学调剂 ，六级已过，有科研经历
已经有12人回复
-
294求调剂材料与化工专硕
已经有13人回复
-
288求调剂
已经有14人回复
-
307求调剂
已经有8人回复
-
一志愿南京理工大学085701资源与环境302分求调剂
已经有5人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 用pMD 19-T做克隆之后用哪对通用引物做菌落PCR以及测序呢？
已经有7人回复
- 测序结果中不到引物
已经有5人回复
- 16S测序结果不一样什么原因？
已经有7人回复
- pcr测序结果分析
已经有15人回复
- 转录组测序后的序列在NCBI上BLAST后遇到的一些问题，求解答
已经有5人回复
- 测序结果出现单碱基的重叠峰
已经有6人回复
- 求助 测序得到条带NCBI上没有同源序列
已经有8人回复
- 测序结果去除载体序列
已经有3人回复
- "测序完成，结果双峰" 这样的结果需要重新PCR ，重新测序吗？
已经有8人回复
- 测序结果——无信号！ 是什么原因？？？
已经有11人回复
- 基因测序结果比对
已经有5人回复
- 帮忙看一下一个有关SNP的测序结果图！
已经有4人回复
- 求问：解读NCBI 保守结构域分析结果
已经有11人回复
- 已取得基因反向测序结果，要先如何处理再上blast比对？
已经有4人回复
- 测序结果发现，在引物位置多了一位碱基，是什么原因引起的？
已经有16人回复
- 质粒测序结果分析
已经有9人回复
- 测序结果的疑问
已经有7人回复
- 【求助/交流】关于ncbi上比对结果的问题
已经有6人回复
- NCBI blast 结果一些参数的含义求高手指点
已经有12人回复
wizardfan
至尊木虫 (著名写手)
- BioEPI: 18
- 应助: 599 (博士)
- 贵宾: 1.818
- 金币: 24632.2
- 散金: 197
- 红花: 48
- 沙发: 2
- 帖子: 2254
- 在线: 400.7小时
- 虫号: 1879241
- 注册: 2012-07-05
- 性别: GG
- 专业: 生物信息学
2楼2014-01-28 03:22:54
小木虫刘树青
木虫 (著名写手)
夜未眠
- 应助: 28 (小学生)
- 金币: 2283.4
- 散金: 1211
- 红花: 37
- 帖子: 1090
- 在线: 206.3小时
- 虫号: 1132496
- 注册: 2010-10-26
- 性别: GG
- 专业: 生物信息学
★
137167741: 金币+1, 小木虫交流，共同进步~~ 2014-01-28 11:29:33
137167741: 金币+1, 小木虫交流，共同进步~~ 2014-01-28 11:29:33
|
蛋白的isoform是？请问怎么比对蛋白质序列啊？我用premer5里面核酸序列转换成蛋白质氨基酸的功能，比对后与NCbi上的CDS核酸序列翻译的蛋白质氨基酸只有30%相似，我是不是比错了，我是不是只用相似的核酸序列比对啊，也就是93-183以外的那些核酸序列翻译成的蛋白氨基酸与NCBI上的CDS翻译的蛋白质氨基酸比对啊？ 我挑了8个，做了菌液PCR，只有三个P出目的条带，所以测序的是三个，这三个都是一样的，我直接让测序公司拼接的，多的序列在测序结果的93-183，另外在其他部位还有多1-2个碱基的现象，只有几处，但是93-183这段不知道是什么？ |
3楼2014-01-28 09:49:03
4楼2014-01-28 11:30:29
小木虫刘树青
木虫 (著名写手)
夜未眠
- 应助: 28 (小学生)
- 金币: 2283.4
- 散金: 1211
- 红花: 37
- 帖子: 1090
- 在线: 206.3小时
- 虫号: 1132496
- 注册: 2010-10-26
- 性别: GG
- 专业: 生物信息学
5楼2014-01-28 11:49:41
6楼2014-01-28 12:41:34
小木虫刘树青
木虫 (著名写手)
夜未眠
- 应助: 28 (小学生)
- 金币: 2283.4
- 散金: 1211
- 红花: 37
- 帖子: 1090
- 在线: 206.3小时
- 虫号: 1132496
- 注册: 2010-10-26
- 性别: GG
- 专业: 生物信息学
7楼2014-01-28 12:43:45
biology-girl
新虫 (正式写手)
- 应助: 33 (小学生)
- 金币: 915.7
- 散金: 23
- 红花: 3
- 帖子: 959
- 在线: 131.6小时
- 虫号: 2403242
- 注册: 2013-04-06
- 性别: MM
- 专业: 微生物生理与生物化学
8楼2014-07-19 08:57:51
