应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » pcr测序结果分析
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
161/2返回列表12下一页
查看: 3434  |  回复: 15
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

yuren2009

木虫 (正式写手)

[求助] pcr测序结果分析 已有3人参与

问个低级问题：PCR产物双向测序怎么理解？我要鉴定的是真菌，测序结果是每个样品四个文件，两个seq文件，两个ab1文件，序列拼接到底是指各次反应后的片段连接还是找到重叠区？新手刚接触分子生物这块儿。
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
学习使你立于不败之地
1楼 2013-08-29 23:38:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

Sthunder

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰，手有余香。分子生物期待你更多精彩 2013-08-30 09:24:23
yuren2009: 金币+5, ★★★★★最佳答案 2013-08-30 09:37:30
由于片段过长，一个反应无法测通，所以用双向，它是同时从3 和5'端测序，当然结果你会有两个序列，然后将两个方向测序结果比对，通过重叠区，将其拼接成一个完整序列。seq文件是序列，ab1文件是测序峰图，不同颜色代表不同碱基，根据峰的情况可以看出测序效果。Good luck！
赞一下(3人) 回复此楼
互助互励，共奋共进！！
2楼2013-08-30 01:26:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

小鞋匠126_

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖应助！ 2013-08-30 11:34:31
先找重复片段，然后从重复片段开始进行拼接
赞一下(2人) 回复此楼
4楼2013-08-30 09:56:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wsh01300

铜虫 (小有名气)
★ ★
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流！ 2013-08-30 11:34:38
要测通了才能进行拼接，如果PCR产物片段太长无法测通的话双向测序获得的片段间没有重叠片段，将无法进行拼接。
赞一下(1人) 回复此楼
5楼2013-08-30 10:00:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

bugakbug

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
引用回帖:
6楼: Originally posted by yuren2009 at 2013-08-30 10:32:11
700左右...

与一般有效的sequence长度(600~1000bp)差不多，
剩下的就要看交叉重复的区段够不够多啰
赞一下(1人) 回复此楼
7楼2013-08-30 10:44:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

roomofxw

木虫 (正式写手)
★ ★
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖应助！ 2013-08-30 18:04:08
有专门的软件可以拼接
另外我都是让测序公司拼个序列结果给我的
再另外基因不长一个反应就测完的就不需要拼接了
赞一下(1人) 回复此楼
8楼2013-08-30 16:22:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

yuren2009

木虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by Sthunder at 2013-08-30 01:26:36
由于片段过长，一个反应无法测通，所以用双向，它是同时从3 和5'端测序，当然结果你会有两个序列，然后将两个方向测序结果比对，通过重叠区，将其拼接成一个完整序列。seq文件是序列，ab1文件是测序峰图，不同颜色代 ...

用DNASTAR拼接时候不用考虑方向？
赞一下 回复此楼
学习使你立于不败之地
3楼2013-08-30 09:39:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yuren2009

木虫 (正式写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by wsh01300 at 2013-08-30 10:00:46
要测通了才能进行拼接，如果PCR产物片段太长无法测通的话双向测序获得的片段间没有重叠片段，将无法进行拼接。

700左右
回复此楼
学习使你立于不败之地
6楼2013-08-30 10:32:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

putine

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
yuren2009: 金币+2, ★★★很有帮助 2013-08-30 21:35:50
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流！ 2013-08-30 21:39:36
700的话通常一个反应就够了，如果你的测序结果足够好的话。另外测序公司可以帮你拼接的。如果自己拼接的话，需要借助一些软件
赞一下 回复此楼
9楼2013-08-30 20:48:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yuren2009

木虫 (正式写手)
引用回帖:
9楼: Originally posted by putine at 2013-08-30 20:48:22
700的话通常一个反应就够了，如果你的测序结果足够好的话。另外测序公司可以帮你拼接的。如果自己拼接的话，需要借助一些软件

做的双向，自己用软件也拼接出来了。就是不清楚公司发的序列是不是反转后的。
赞一下 回复此楼
学习使你立于不败之地
10楼2013-08-30 21:37:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 yuren2009 的主题更新
161/2返回列表12下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 环境专硕调剂 +6 会说话的肘子 2026-04-06 6/300 2026-04-07 02:00 by Sealedwind
[考研] 生物学调剂 可调剂到生物与医药 +3 李政莹 2026-04-06 3/150 2026-04-06 19:02 by macy2011
[考研] 一志愿武理车辆专硕总分 281 求调剂 +3 上岸研究生. 2026-04-02 3/150 2026-04-06 16:46 by 小月儿呀呀
[考研] 材料工程310专硕调剂 +14 捞捞我…. 2026-04-04 15/750 2026-04-06 14:18 by lqwchd
[考研] 材料调剂 +6 一样YWY 2026-04-05 6/300 2026-04-05 20:30 by 南航~万老师
[考研] 327求调剂 +4 拾光任染 2026-04-05 4/200 2026-04-05 20:16 by 南航~万老师
[考研] 工科277分求调剂材料 +8 上了上了上哦 2026-04-05 9/450 2026-04-05 13:05 by wwytracy
[考研] 生物工程求调剂 +6 喜欢还是不甘心 2026-04-05 6/300 2026-04-05 10:28 by 唐沐儿
[考研] 315求调剂 +13 小羊小羊_ 2026-04-02 14/700 2026-04-04 20:30 by 蓝云思雨
[考研] 调剂 +9 19945159693 2026-04-03 10/500 2026-04-04 20:16 by dongzh2009
[考研] 331求调剂 +3 niby 2026-04-02 3/150 2026-04-04 19:56 by 蓝云思雨
[考研] 368求调剂 +5 今华习 2026-04-03 7/350 2026-04-04 18:47 by imissbao
[考研] 319求调剂 +4 星星不眨眼喽 2026-04-03 4/200 2026-04-04 16:25 by 中飞院空管学院�
[考研] 283分材料与化工求调剂 +29 罗KAKA 2026-04-02 29/1450 2026-04-03 23:56 by userper
[考研] 305求调剂 +3 77Qi 2026-04-03 3/150 2026-04-03 23:01 by qzxyhcsy
[考研] 一志愿北京交通大学材料工程总分358 +4 cs0106 2026-04-03 4/200 2026-04-03 13:41 by 百灵童888
[基金申请] 请问共同通讯和共同一作的认可度问题 10+4 psa1234 2026-04-01 10/500 2026-04-03 11:08 by Kittylucky
[考研] 295求调剂 +7 愿旅途永远坦然 2026-04-02 7/350 2026-04-03 08:22 by fangshan711
[考研] 土木304求调剂 +6 兔突突突， 2026-03-31 7/350 2026-04-02 09:06 by coolminer
[考研] 省双一流重点一本大学招收调剂 +4 wwwwffffff 2026-03-31 7/350 2026-04-01 15:23 by wwwwffffff
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭