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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 【求助/交流】基因测序结果分析问题
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xiaoru2010

[交流] 【求助/交流】基因测序结果分析问题 已有6人参与

用同一对引物在果实的不同时期扩增，均得到长度为146的片段，每个时期的片段挑10个去测序，结果分为大概分为两组相似度有差异的基因序列，每一组里各个序列之间有2-4个碱基的差异或缺失，请问每个样都算一个基因吗？如果是的话基因片段序列最终怎么确定？
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1楼 2010-06-29 09:32:29
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xiaoru2010

高手快浮出水面吧！
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2楼2010-06-29 10:06:38
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dianaofyezi

金虫 (正式写手)
★
1949stone(金币+1):好多问题 不过楼至的确没说清楚 2010-06-29 17:21:17
送去测序的是PCR产物还是克隆后产物？
每组里面差异基因位置相同么？
你测定的基因是否为保守基因呢？
你测定的基因缺失是否在同一位置呢？
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52187644
3楼2010-06-29 10:32:06
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thh2008

铜虫 (初入文坛)
★
reasonspare(金币+1):谢谢分享。 2010-07-03 06:06:29
引用回帖:
Originally posted by dianaofyezi at 2010-06-29 10:32:06:
送去测序的是PCR产物还是克隆后产物？
每组里面差异基因位置相同么？
你测定的基因是否为保守基因呢？
你测定的基因缺失是否在同一位置呢？

是克隆后的菌液。
位置有些碱基相同，有些不同。
是保守基因。
缺失不在同一位置。
谢谢！
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4楼2010-06-29 10:47:25
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dianaofyezi

金虫 (正式写手)
★ ★ ★
lmzxcom1(金币+1):鼓励积极交流 2010-06-29 11:41:46
1949stone(金币+2):谢谢交流 2010-06-29 17:21:26
如果是保守基因应该不会出现你说的突变和缺失这么多的情况。而且你的片段比较短测序出现这样的问题可能性也不会很大。我还是建议你好好找下PCR过程中的问题。因为出现突变和缺失的愿意最大的可能就是PCR过程和克隆过程了。另外你是做的不同时期的扩增，既然是保守基因不会因为在不同时期出现很大变化才对，否则怎么叫保守基因呢。
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52187644
5楼2010-06-29 10:54:16
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xiajungang

银虫 (正式写手)
我也出现了这个问题。
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吃苦耐劳，勇于创新，乐观热情，积极向上！
6楼2010-06-29 11:21:48
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xiajungang

银虫 (正式写手)
反正挺郁闷的
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吃苦耐劳，勇于创新，乐观热情，积极向上！
7楼2010-06-29 11:22:21
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xiaoru2010

将其氨基酸序列进行比对，得出5个不同的基因（有一个氨基酸的差异就算），视为5个基因吧？
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8楼2010-07-02 15:47:09
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陈思容

铜虫 (正式写手)
★
reasonspare(金币+1):谢谢分享。 2010-07-03 06:06:49
高保真 PCR，P完后直接送出去测序，
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9楼2010-07-02 16:13:44
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silicare

荣誉版主 (文坛精英)

合伙创业版兼职版主

优秀版主
楼上正解
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10楼2010-07-02 18:37:00
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