应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » pcr测序结果分析
162/2返回列表上一页12
查看: 3237  |  回复: 15
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

feitianzhu11

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

自己拼接的话用什么软件比较好呢？
赞一下 回复此楼
11楼2014-06-18 16:55:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yuren2009

木虫 (正式写手)
引用回帖:
11楼: Originally posted by feitianzhu11 at 2014-06-18 16:55:46
自己拼接的话用什么软件比较好呢？

DNAstar中的Seqman
赞一下 回复此楼
学习使你立于不败之地
12楼2014-06-18 17:18:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

丫头珠

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by Sthunder at 2013-08-30 01:26:36
由于片段过长，一个反应无法测通，所以用双向，它是同时从3 和5'端测序，当然结果你会有两个序列，然后将两个方向测序结果比对，通过重叠区，将其拼接成一个完整序列。seq文件是序列，ab1文件是测序峰图，不同颜色代 ...

你好，我想请问一下，两个方向的测序结果怎么拼接成一个完整的序列？
赞一下 回复此楼
13楼2015-01-30 14:43:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Sthunder

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
13楼: Originally posted by 丫头珠 at 2015-01-30 14:43:30
你好，我想请问一下，两个方向的测序结果怎么拼接成一个完整的序列？...

很多软件都可以拼接哈，比如NAstar、Bioedit、contig、ChromasPro DNA、Sequencher、Vector NTI、Stand Package、ContigExpress等。你直接将两段序列加进去就好，软件会自己识别。如果你没有软件的话就用死办法好了。由于是双向，所以要将用反向引物测序所得序列进行反向互补，然后将两个序列放到word中，用word寻找功能查询反向序列的5‘端，理论上再正向测序结果中会找到对应的序列。然后手动拼接就好。
赞一下 回复此楼
互助互励，共奋共进！！
14楼2015-01-31 01:48:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

丫头珠

金虫 (小有名气)
引用回帖:
14楼: Originally posted by Sthunder at 2015-01-31 01:48:36
很多软件都可以拼接哈，比如NAstar、Bioedit、contig、ChromasPro DNA、Sequencher、Vector NTI、Stand Package、ContigExpress等。你直接将两段序列加进去就好，软件会自己识别。如果你没有软件的话就用死办法好了 ...

好的，多谢！
回复此楼
15楼2015-01-31 14:33:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xxdscdx

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

ab1文件是峰图，一般不用管。seq文件是从ab1文件导出的序列文件。
双向测序是指，一个正向（5到3）测序，另一个则是反向测序（测出来为正向模板序列的反补序列）。序列拼接是先要找到重叠区，然后再连接。
赞一下 回复此楼
16楼2015-01-31 15:37:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 yuren2009 的主题更新
162/2返回列表上一页12
普通表情 龙 兔 虎 猫
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭