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ciwei98

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liuderong

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
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gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流! 2014-08-01 14:49:57
应该是测序后组装的问题,用不同的方法组装会有差异。也有可能是你们测序用的材料中,这个基因本身就带有插入序列。
2楼2014-08-01 11:29:07
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ciwei98

禁虫 (小有名气)

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3楼2014-08-01 14:48:09
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happydove

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
怎么是分成两部分?
这可能是测序问题。
这类问题要回答就做一个PCR扩增,然后sanger测序一下就知道了,否则很难说的
4楼2014-08-01 16:07:30
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luwei13566

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
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ciwei98(西门吹雪170代发): 金币+2, 鼓励回帖交流 2014-08-03 19:07:00
引用回帖:
3楼: Originally posted by ciwei98 at 2014-08-01 14:48:09
这个基因被分成的两部分,前面基因的3端与下个基因的5端有14bp的重复,前面基因的3端有n值。...

1 测序后基因拼接重复了,重新拼接就好。
2 N是那个点测序信号不明显或者峰值太乱无法确认

[ 发自小木虫客户端 ]
大家相互帮助哈
5楼2014-08-01 16:23:19
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柠萌粉

铜虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
ciwei98(西门吹雪170代发): 金币+1, 鼓励回帖交流 2014-08-03 19:07:10
楼上大家都说得差不多了,你可以把accession number发出来,我猜多半你说的两个“基因”,根本不是基因,就只是config
6楼2014-08-01 16:29:00
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ciwei98

禁虫 (小有名气)

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7楼2014-08-03 15:14:31
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ciwei98

禁虫 (小有名气)

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8楼2014-08-03 15:17:09
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liuderong

铁杆木虫 (正式写手)

引用回帖:
8楼: Originally posted by ciwei98 at 2014-08-03 15:17:09
有插入序列?这个基因正常的我的这种菌中都有这个基因,在ncbi中这个基因都是1350bp的。那这就是测序的问题?...

你要是真的需要确认,那就从两端设计一对引物,PCR后重新再测。
9楼2014-08-03 20:37:13
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