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怎样在NCBI中查找一物种的全基因组?
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陈年芬芳
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怎样在NCBI中查找一物种的全基因组?
做虫虫的,也不知道这个有没有全基因组序列,但是不知道在哪儿查?求高人指点,谢谢啦!
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1楼
2012-04-23 10:59:01
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wuxmxjtu
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robertorun
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在NCBI中的Taxonomy数据库中检索你所关心的拉丁文,然后可以看到所有有关该物种的各类数据信息;你想看基因组,直接看检索出来的Genome情况
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10楼
2012-04-26 09:42:56
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karryxu
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2012-04-24 20:36:45
首先进入NCBI的主页,在搜索框中输入你想要的查找你的物种名就可以了。
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2012-04-23 14:44:12
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西瓜: 金币+1, 鼓励应助
2012-04-23 18:30:12
打开首页,点Nucleotide,然后输入你的物种的英文名,或者是这个物种在GenBank上的序列号,搜索就可以找到,你试试吧。
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未来不是梦
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2012-04-23 15:14:37
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张宏宇123
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你输入的是菌名吧?是不是没有序列号啊?你查没查其他文献做这个菌的,不同的人做的序列号也不一样,如果没有的话,有可能这个菌的全基因组序列还没有测。
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未来不是梦
5楼
2012-04-24 21:45:58
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陈年芬芳
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Originally posted by
张宏宇123
at 2012-04-23 15:14:37:
打开首页,点Nucleotide,然后输入你的物种的英文名,或者是这个物种在GenBank上的序列号,搜索就可以找到,你试试吧。
谢谢,我这样就得到了500多条结果,各种基因的,我想知道的是,这个物种的全基因组是否有人公布,这个怎么看啊?
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4楼
2012-04-24 20:41:16
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陈年芬芳
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张宏宇123
at 2012-04-24 21:45:58:
你输入的是菌名吧?是不是没有序列号啊?你查没查其他文献做这个菌的,不同的人做的序列号也不一样,如果没有的话,有可能这个菌的全基因组序列还没有测。
我查的是昆虫,在国外早就被研究的和清楚了,但是数据库没有,你知道其他可以查全基因组的数据库吗?谢谢啦。
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7楼
2012-04-25 09:56:38
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陈年芬芳
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wuxmxjtu
at 2012-04-24 21:52:09:
在ncbi页面搜索,左边选择genome, 右边输入你的物种名,搜索,会出现一个页面,上面显示相关物种的进化树,点开你需要的物种名,出现相关信息,点击其在ncbi的序列号,就可以看到基因组信息了,前提是有这个物种的 ...
谢谢,按照你的方法找,没有结果,那可能就是我那个物质还没有公布吧?
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8楼
2012-04-25 09:58:29
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9楼
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