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霍烨zz

银虫 (小有名气)

[求助] RNA提取及电泳已有1人参与

提取的肠道粘膜RNA,测了OD值,结果如下:
RNA提取及电泳

还想检测下完整性,所以跑了电泳
用的是1%琼脂糖+2ul golden view
5ul RNA + 5ul 2X RNA loading dye (65℃,变性10min)
然后110V,跑了30min,结果却是这么个样子:(上样量8ul)

RNA提取及电泳-1

不知道是出了什么问题呢?

另,因为是要做转录组测试,所以公司对样品要求比较严格,说是跑胶必须是28S和18S两条带的比例接近2
但我有个疑问,就是转录组测序主要是针对mRNA,而mRNA在total RNA中只占1~5%,几乎都不能在胶上看到,那么电泳胶没跑好就一定意味着做不了测序吗?
像我这种情况送样给公司,能有多大把握成功测序?
谢谢大家了!!
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leopard2011

新虫 (初入文坛)

RNA要稀释的,不稀释用原液跑胶就是这样,你稀释30-100倍看看

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3楼2014-11-20 09:45:01
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