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guyue900905

新虫 (初入文坛)

[求助] 提取RNA后跑电泳,条带非常不清晰怎么回事啊?我是新手,谢谢啦!

我刚刚开始提取RNA,采用研钵提取的方法,提出的RNA测OD值,280/260还好在1.9~2.1之间,但是260/230特别的小,在1之下,操作中手套,口罩都有带,实在不知道是什么原因?想知道解决的方法。
     同时,我提取完就跑了电泳,但是28s条带、18s条带基本没有,5s条带很清楚,不知道怎么会降解的这么严重。跑电泳时,120伏,6分钟。
   谢谢啦!
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jl860822

金虫 (正式写手)


【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
用什么方法提取的?一定要注意一些小细节
2楼2012-07-17 09:49:26
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guyue900905

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by jl860822 at 2012-07-17 09:49:26
用什么方法提取的?一定要注意一些小细节

我用的是trizol法,测得的OD挺好的,电泳图特别差不知道为什么
3楼2012-07-18 18:35:12
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jl860822

金虫 (正式写手)


【答案】应助回帖

OD值测定结合跑胶鉴定比较好,你能传一下电泳图大家看看吗?
4楼2012-07-18 19:10:40
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reallpf

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
个人认为很大可能性是你研磨过度的问题。
5楼2012-07-18 19:24:24
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tupac225

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
guyue900905: 金币+2, 有帮助 2012-08-02 16:14:53
提取rna应该注意环境清洁,容器、溶液无RNase。
你是用研磨的方法,所以特别注意低温防降解。
这是一些注意事项,希望对你有用:
1、将研钵,研杵,试剂瓶,容量瓶(配溶液用),三角瓶(溶胶用),药匙,玻璃棒等,用锡箔纸包住在烘箱中高温烘烤(180℃ 8hr,或200℃ 4hr)。
2、 配0.1% DEPC-H2O:将DEPC母液按比例(H2O:DEPC=1000:1)溶于双蒸水中,在37℃摇床上摇荡过夜,注意避免光照。DEPC-H2O主要作两种用途,一则用于处理试验中所用的器具,如不能高温烘烤的离心管等,除RNA酶,作此用途时不能高压灭菌,一则是用于配制提取过程中所用的溶液,如5M Nacl溶液,75%酒精等,配制前先要高压灭菌。故配制时或一次配两份,或配后用高温烘烤过的试剂瓶分装。注意:DEPC是挥发性有毒试剂,且见光分解,配制时注意防护,最好单独灭菌,配后避光保存。
3、 定购无RNase的专用枪头和Eppendorf管。否则,要用DEPC水处理并且摇荡过夜,然后高压灭菌。
4、用DEPC水配制Nacl溶液,75%酒精,及MOPS缓冲液等;氯仿、异丙醇,无水乙醇等用新开封的试剂,最好用烘烤过的试剂瓶分装。
⑤ 将电泳槽,制胶槽、梳子用0.1mol/L NaOH洗涤浸泡10-20min,然后用DEPC-H2O冲洗干净,再用75%的酒精擦拭干,备用。
⑥ 准备消毒的厚手套一双,乳胶手套若干双。
coasttocoast。
6楼2012-07-18 22:41:54
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xjtu0025

新虫 (小有名气)

260/230很小,如果你是用trizol法提的,很简单你最后洗75%乙醇的时候多洗几遍,最后晾干的时候多晾一下。基本上洗4遍才能把值升到1以上,不会影响后期酶反应。
提RNA就三个窍门吧,低温,无酶,快。
我之前提也是新手,后来就算旁边有人跟我聊天。基本也没有什么降解的风险,数值也不错。注意所有接触到RNA的东西,你都要用DEPC水处理过。小强头建议你用新的盒装除酶的。。
7楼2013-05-08 11:44:28
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