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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » RNA电泳结果分析
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suijinkai

木虫 (小有名气)

[求助] RNA电泳结果分析

如图，我提的是杨树的RNA，天泽基因的盒子，结果跑出来这么多条带，不知道是咋回事，求高手指点（详细分析）！


[ Last edited by suijinkai on 2011-11-11 at 15:05 ]
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机会只给有准备的人！
1楼 2011-11-11 14:12:01
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咿呀咿呀225

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
amisking(金币+4): 鼓励新虫发帖交流！ 2011-11-11 18:37:11
amisking(金币+4): 鼓励新虫发帖交流！ 2011-11-11 18:37:11
存在RNA断裂或者含DNA杂质吗？
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2楼2011-11-11 15:36:11
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wqj1988926

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

suijinkai(金币+1): 多谢建议！ 2011-11-13 21:56:19
降解的挺厉害的，最好还是重提吧，多提几次就会好的
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风雪夜归人
3楼2011-11-11 21:31:59
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钟心碧

金虫 (小有名气)

心碧

【答案】应助回帖

suijinkai(金币+1): 看结果来说降解还是有一些的，但是应该能往下做，谢谢！ 2011-11-13 21:55:39
suijinkai: 回帖置顶 2011-12-02 10:24:29
这个总体来说，是没有问题的，你做反转的话，就大胆的往下做吧！基本没什么降解。
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灵魂是否存在
4楼2011-11-12 10:25:21
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hongtao_s409

铁虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

上面一排（除了最后一个条带），和下面一排最后三个结果还是很好的，往下做应该问题不大，
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5楼2011-11-12 11:41:36
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suijinkai

木虫 (小有名气)
我知道可以继续往下做反转，但是就想知道跑成这种结果的原因。我问了他们公司的技术，说是他们的试剂会促使RNA二级结构的形成，如果不用甲醛变性凝胶电泳的话就会出现这种情况——有多条杂带。不知道这个解释可靠否，想听听大家的意见，补充一下：我用的是非变性胶。
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机会只给有准备的人！
6楼2011-11-12 15:41:25
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longrna

新虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

本人觉得提的挺好的。应该不是降解，因为降解不可能都降解成统一大小的条带（都降解成5S大小例外）。
俺猜测可能有以下几方面原因：
1）物种方面原因。有些植物物种本身存在多条RNA条带的情况，或者不同的生物阶段也有关系。相信做水稻的同学也会有这个感觉，有时提出的RNA就是有多条带，有时不会。
2）上样量原因。81 82 83这几个乍一看挺好的，挺正常的。其实如果仔细看底下还是有那种多带。

至于技术支持说的二级结构，跑变性胶，你可以尝试一下，结果希望能与我们分享，我也很想知道。
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伟大航线....
7楼2011-11-12 19:07:14
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zaasyangyong

金虫 (正式写手)
LZ跑一下变性胶，回来共享结果，我也很想知道原因。
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算了
8楼2011-11-12 21:06:53
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suijinkai

木虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 咿呀咿呀225 at 2011-11-11 15:36:11:
存在RNA断裂或者含DNA杂质吗？

DNA杂质应该是没有的，因为提取的过程中除过了；RNA断裂就不知道了，但是感觉应该不是这个原因，他不可能都断的一样大小吧。
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机会只给有准备的人！
9楼2011-11-13 21:53:45
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wangy0908

金虫 (正式写手)
引用回帖:
9楼: Originally posted by suijinkai at 2011-11-13 21:53:45:
DNA杂质应该是没有的，因为提取的过程中除过了；RNA断裂就不知道了，但是感觉应该不是这个原因，他不可能都断的一样大小吧。

这个RNA的质量很好的，应该是没有跑变性胶的问题，所以出现了多带的现象。RNA没有讲解，否者不会有明显的主带。所以大胆的往下做。祝好运的
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10楼2011-11-14 07:50:45
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