24小时热门版块排行榜    

查看: 9610  |  回复: 14

foxhuli

木虫 (正式写手)


[交流] cDNA凝胶电泳结果分析

这是我的cDNA PCR结果,麻烦大家帮忙分析一下,因为我们实验室几乎不涉及这一块,我也是偶然做这一部分。从人肝癌细胞中提取的RNA,然后经RT-PCR,逆转录成cDNA。电泳我用的是1.5%琼脂糖,1*TBE,65V,90min,每孔10μl左边两个是RNA,中间是1kb mark,右边两个是pcr产物,有专业人士能看一下这是否p成功了吗?

RNA,DNA.jpg
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

» 抢金币啦!回帖就可以得到:

查看全部散金贴

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖置顶 ( 共有1个 )

dafeizizhu

铜虫 (小有名气)


★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
gyesang: 回帖置顶 2013-05-02 12:06:14
foxhuli(gyesang代发): 金币+2, 热心的虫子,忠言逆耳! 2013-05-02 12:06:56
foxhuli: 金币+2 2013-05-02 20:57:44
首先,绝大多数人看电泳图都是点样孔在上边,偶尔有人这样放的。这就是另类。其次,要让人看明白电泳图,必须使用图片处理软件将每个电泳孔都标注清楚了。下面我来说说关于cDNA问题:一般情况下,要检验RNA提取结果如何,好的RNA是明显的两条带,28s和18s,大小分别在1900bp和1000bp左右,28s条带亮度是18s条带亮度的1-2倍,这样的RNA才是好的,才可以用来做cDNA。再者,要检测cDNA质量也行,cDNA合成试剂盒一般情况下都会给对照mRNA,合成cDNA过程中,一起做这个对照,它的产物是一条1400bp的条带(takara试剂盒是这样的),电泳检测时,如果对照出现了1400bp条带,说明你整个cDNA反转录过程是没有问题的。正式样品的条带,就应该看你使用的是什么引物了,如果是试剂盒给的olig引物,产物是弥散的条带,没有特异条带。如果你使用的是特异引物,也就是你自己合成的目的基因的引物,那产物就是一条带,多了不对。从图中看,RNA提取就是问题,跟不用说后面实验了。
9楼2013-05-02 10:03:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

zhlf1989513

金虫 (小有名气)


★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
foxhuli(gyesang代发): 金币+1, 鼓励回帖应助! 2013-05-02 12:07:08
楼主PCR的目的片段式多长呢?RNA有降解,但是逆转录还是可以逆出cDNA出来,逆了cDNA后可以P个内参(GAPDH)来检测下cDNA是否有问题。如果没有问题就可以进行PCR你的目的条带了。。。但是首先你得知道的目的片段是多长啊。。。
10楼2013-05-02 10:09:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

nmhsd

木虫 (正式写手)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
没有哪位大神会告诉你能从cDNA电泳看出来是否RT成功。继续做下面的吧!
11楼2013-05-02 11:04:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

renzhiq

木虫 (小有名气)


★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
foxhuli(gyesang代发): 金币+2, 鼓励回帖应助! 2013-05-01 21:03:32
你的表述有点问题,没有明白你是用cDNA做模板进行pcr还是直接检测反转录的情况,cDNA质量(很少有人会这么做)
不管怎么样,您右边都是没有产物的。实验没有成功!
2楼2013-05-01 19:26:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

foxhuli

木虫 (正式写手)


引用回帖:
2楼: Originally posted by renzhiq at 2013-05-01 19:26:03
你的表述有点问题,没有明白你是用cDNA做模板进行pcr还是直接检测反转录的情况,cDNA质量(很少有人会这么做)
不管怎么样,您右边都是没有产物的。实验没有成功!

就是用RNA进行逆转录的啊,那如何检测是否成功呢
3楼2013-05-01 22:10:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

foxhuli

木虫 (正式写手)


引用回帖:
2楼: Originally posted by renzhiq at 2013-05-01 19:26:03
你的表述有点问题,没有明白你是用cDNA做模板进行pcr还是直接检测反转录的情况,cDNA质量(很少有人会这么做)
不管怎么样,您右边都是没有产物的。实验没有成功!

就是用RNA进行逆转录的啊,那如何检测是否成功呢
4楼2013-05-01 22:11:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

andywang6137

木虫 (著名写手)


★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
foxhuli(gyesang代发): 金币+1, 鼓励回帖交流! 2013-05-02 12:05:17
为什么不把图像正放过来呢?检测也是直接电泳检测RNA,几乎没有人检测反转录后的cDNA,反转录试剂还是比较贵的。右边2个孔只有引物二聚体,没有PCR产物。
6楼2013-05-02 08:36:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

renzhiq

木虫 (小有名气)


★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
foxhuli(gyesang代发): 金币+1, 鼓励回帖应助! 2013-05-02 12:05:30
检测很简单啊。你用通用引物,以cDNA为模板进行扩增,再跑胶就可以了……
7楼2013-05-02 09:23:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

guaiyaya

铜虫 (初入文坛)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
你的CDNA片段是多长?
8楼2013-05-02 09:25:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

foxhuli

木虫 (正式写手)


引用回帖:
9楼: Originally posted by dafeizizhu at 2013-05-02 10:03:14
首先,绝大多数人看电泳图都是点样孔在上边,偶尔有人这样放的。这就是另类。其次,要让人看明白电泳图,必须使用图片处理软件将每个电泳孔都标注清楚了。下面我来说说关于cDNA问题:一般情况下,要检验RNA提取结果 ...

谢谢哦,新手上路,太容易开到河里去了。受教
12楼2013-05-02 20:55:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

foxhuli

木虫 (正式写手)


引用回帖:
11楼: Originally posted by nmhsd at 2013-05-02 11:04:51
没有哪位大神会告诉你能从cDNA电泳看出来是否RT成功。继续做下面的吧!

恩,继续重复
13楼2013-05-02 20:57:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dafeizizhu

铜虫 (小有名气)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
9楼: Originally posted by dafeizizhu at 2013-05-02 10:03:14
首先,绝大多数人看电泳图都是点样孔在上边,偶尔有人这样放的。这就是另类。其次,要让人看明白电泳图,必须使用图片处理软件将每个电泳孔都标注清楚了。下面我来说说关于cDNA问题:一般情况下,要检验RNA提取结果 ...

希望我们共同进步
14楼2013-05-07 15:40:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

foxhuli

木虫 (正式写手)


引用回帖:
9楼: Originally posted by dafeizizhu at 2013-05-02 10:03:14
首先,绝大多数人看电泳图都是点样孔在上边,偶尔有人这样放的。这就是另类。其次,要让人看明白电泳图,必须使用图片处理软件将每个电泳孔都标注清楚了。下面我来说说关于cDNA问题:一般情况下,要检验RNA提取结果 ...

打扰,我还想问一下,是不是只要是同一个物种,GSTπ基因序列是一样的呢?  嘿嘿 ,外行了
15楼2013-05-11 18:39:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
简单回复
2013-05-01 22:27   回复  
相关版块跳转 我要订阅楼主 foxhuli 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 什么时候开奖? +3 CrisMessi 2026-08-18 3/150 2026-08-18 23:38 by 必须成功
[基金申请] 咱们一起用铁证分析2026国家社科基金中标与否 +7 启萌科技 2026-08-12 27/1350 2026-08-18 21:44 by Noways
[教师之家] 为什么余额宝的年化利率越来越低?主要原因有哪些? +3 瞬息宇宙 2026-08-15 3/150 2026-08-18 21:40 by xiaohuixin
[基金申请] 2027广东省杰青 +3 奶牛小黑 2026-08-15 9/450 2026-08-18 20:09 by 奶牛小黑
[基金申请] 朋友圈看到的 +4 wangzilk 2026-08-18 5/250 2026-08-18 19:25 by wangzilk
[基金申请] 欢迎发来filecode的Mz6后的代码验证其规律 +51 医学老男孩 2026-08-13 110/5500 2026-08-18 19:07 by icerianxia
[基金申请] 明天放榜? +5 Shxjjxjkx 2026-08-18 5/250 2026-08-18 18:14 by -大大大大大-
[论文投稿] 投稿咨询 +4 wwm09 2026-08-17 6/300 2026-08-18 15:36 by wwm09
[基金申请] 时间戳又变了8-15 +14 archvillain 2026-08-15 26/1300 2026-08-18 13:37 by phantomgost
[基金申请] 今天维护系统维护 祝所有人 高中 +8 gjjjzhong 2026-08-18 9/450 2026-08-18 13:01 by 家与远方
[基金申请] 哪位老哥知道今年的国自然具体哪一天放榜? +13 Ldrop2023 2026-08-13 16/800 2026-08-18 12:25 by 淀粉搬运工
[基金申请] 感觉是下周放榜了 +6 angus9576 2026-08-17 11/550 2026-08-17 23:57 by angus9576
[基金申请] filecode=后面第一个是大写字母 +8 wangze12014 2026-08-14 10/500 2026-08-17 17:05 by xter9665
[基金申请] 今天系统多次维护,明天很可能放榜! +8 zju2000 2026-08-16 9/450 2026-08-17 12:20 by lmz0216
[精细化工] 招聘 金属平磨液,抛光液研发工程师 +3 小天0311 2026-08-14 3/150 2026-08-16 07:31 by H9PLUS
[基金申请] 各位道友,我要去昆明玩几天,回来见。 +7 Tide man 2026-08-14 8/400 2026-08-15 01:11 by arzu_hma
[基金申请] 重要来源:本周末出结果 +10 瞬息宇宙 2026-08-12 10/500 2026-08-13 15:46 by likettle
[基金申请] 不应该看fileCode +7 且听虎啸 2026-08-12 9/450 2026-08-13 14:27 by flydreamws
[基金申请] Filecode 又变了,巨变 +3 WH3796 2026-08-12 4/200 2026-08-13 14:13 by 小木虫6752397
[基金申请] 结合人工智能,周易传统文化,filecode打分制来了,3分以上希望很大。 +3 Tide man 2026-08-12 4/200 2026-08-13 08:35 by ZJTJZ
信息提示
请填处理意见