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foxhuli

木虫 (正式写手)


[交流] cDNA凝胶电泳结果分析

这是我的cDNA PCR结果,麻烦大家帮忙分析一下,因为我们实验室几乎不涉及这一块,我也是偶然做这一部分。从人肝癌细胞中提取的RNA,然后经RT-PCR,逆转录成cDNA。电泳我用的是1.5%琼脂糖,1*TBE,65V,90min,每孔10μl左边两个是RNA,中间是1kb mark,右边两个是pcr产物,有专业人士能看一下这是否p成功了吗?

RNA,DNA.jpg
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dafeizizhu

铜虫 (小有名气)


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gyesang: 回帖置顶 2013-05-02 12:06:14
foxhuli(gyesang代发): 金币+2, 热心的虫子,忠言逆耳! 2013-05-02 12:06:56
foxhuli: 金币+2 2013-05-02 20:57:44
首先,绝大多数人看电泳图都是点样孔在上边,偶尔有人这样放的。这就是另类。其次,要让人看明白电泳图,必须使用图片处理软件将每个电泳孔都标注清楚了。下面我来说说关于cDNA问题:一般情况下,要检验RNA提取结果如何,好的RNA是明显的两条带,28s和18s,大小分别在1900bp和1000bp左右,28s条带亮度是18s条带亮度的1-2倍,这样的RNA才是好的,才可以用来做cDNA。再者,要检测cDNA质量也行,cDNA合成试剂盒一般情况下都会给对照mRNA,合成cDNA过程中,一起做这个对照,它的产物是一条1400bp的条带(takara试剂盒是这样的),电泳检测时,如果对照出现了1400bp条带,说明你整个cDNA反转录过程是没有问题的。正式样品的条带,就应该看你使用的是什么引物了,如果是试剂盒给的olig引物,产物是弥散的条带,没有特异条带。如果你使用的是特异引物,也就是你自己合成的目的基因的引物,那产物就是一条带,多了不对。从图中看,RNA提取就是问题,跟不用说后面实验了。
9楼2013-05-02 10:03:14
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renzhiq

木虫 (小有名气)


★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
foxhuli(gyesang代发): 金币+2, 鼓励回帖应助! 2013-05-01 21:03:32
你的表述有点问题,没有明白你是用cDNA做模板进行pcr还是直接检测反转录的情况,cDNA质量(很少有人会这么做)
不管怎么样,您右边都是没有产物的。实验没有成功!
2楼2013-05-01 19:26:03
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foxhuli

木虫 (正式写手)


引用回帖:
2楼: Originally posted by renzhiq at 2013-05-01 19:26:03
你的表述有点问题,没有明白你是用cDNA做模板进行pcr还是直接检测反转录的情况,cDNA质量(很少有人会这么做)
不管怎么样,您右边都是没有产物的。实验没有成功!

就是用RNA进行逆转录的啊,那如何检测是否成功呢
3楼2013-05-01 22:10:36
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foxhuli

木虫 (正式写手)


引用回帖:
2楼: Originally posted by renzhiq at 2013-05-01 19:26:03
你的表述有点问题,没有明白你是用cDNA做模板进行pcr还是直接检测反转录的情况,cDNA质量(很少有人会这么做)
不管怎么样,您右边都是没有产物的。实验没有成功!

就是用RNA进行逆转录的啊,那如何检测是否成功呢
4楼2013-05-01 22:11:00
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