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cDNA凝胶电泳结果分析
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foxhuli
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[交流]
cDNA凝胶电泳结果分析
这是我的cDNA PCR结果,麻烦大家帮忙分析一下,因为我们实验室几乎不涉及这一块,我也是偶然做这一部分。从人肝癌细胞中提取的RNA,然后经RT-PCR,逆转录成cDNA。电泳我用的是1.5%琼脂糖,1*TBE,65V,90min,每孔10μl左边两个是RNA,中间是1kb mark,右边两个是pcr产物,有专业人士能看一下这是否p成功了吗?
RNA,DNA.jpg
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2013-05-01 17:11:43
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dafeizizhu
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gyesang: 回帖置顶
2013-05-02 12:06:14
foxhuli(gyesang代发): 金币+2, 热心的虫子,忠言逆耳!
2013-05-02 12:06:56
foxhuli: 金币+2
2013-05-02 20:57:44
首先,绝大多数人看电泳图都是点样孔在上边,偶尔有人这样放的。这就是另类。其次,要让人看明白电泳图,必须使用图片处理软件将每个电泳孔都标注清楚了。下面我来说说关于cDNA问题:一般情况下,要检验RNA提取结果如何,好的RNA是明显的两条带,28s和18s,大小分别在1900bp和1000bp左右,28s条带亮度是18s条带亮度的1-2倍,这样的RNA才是好的,才可以用来做cDNA。再者,要检测cDNA质量也行,cDNA合成试剂盒一般情况下都会给对照mRNA,合成cDNA过程中,一起做这个对照,它的产物是一条1400bp的条带(takara试剂盒是这样的),电泳检测时,如果对照出现了1400bp条带,说明你整个cDNA反转录过程是没有问题的。正式样品的条带,就应该看你使用的是什么引物了,如果是试剂盒给的olig引物,产物是弥散的条带,没有特异条带。如果你使用的是特异引物,也就是你自己合成的目的基因的引物,那产物就是一条带,多了不对。从图中看,RNA提取就是问题,跟不用说后面实验了。
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9楼
2013-05-02 10:03:14
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zhlf1989513
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2013-05-02 12:07:08
楼主PCR的目的片段式多长呢?RNA有降解,但是逆转录还是可以逆出cDNA出来,逆了cDNA后可以P个内参(GAPDH)来检测下cDNA是否有问题。如果没有问题就可以进行PCR你的目的条带了。。。但是首先你得知道的目的片段是多长啊。。。
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10楼
2013-05-02 10:09:36
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没有哪位大神会告诉你能从cDNA电泳看出来是否RT成功。继续做下面的吧!
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11楼
2013-05-02 11:04:51
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renzhiq
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foxhuli(gyesang代发): 金币+2, 鼓励回帖应助!
2013-05-01 21:03:32
你的表述有点问题,没有明白你是用cDNA做模板进行pcr还是直接检测反转录的情况,cDNA质量(很少有人会这么做)
不管怎么样,您右边都是没有产物的。实验没有成功!
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2楼
2013-05-01 19:26:03
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foxhuli
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renzhiq
at 2013-05-01 19:26:03
你的表述有点问题,没有明白你是用cDNA做模板进行pcr还是直接检测反转录的情况,cDNA质量(很少有人会这么做)
不管怎么样,您右边都是没有产物的。实验没有成功!
就是用RNA进行逆转录的啊,那如何检测是否成功呢
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3楼
2013-05-01 22:10:36
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foxhuli
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renzhiq
at 2013-05-01 19:26:03
你的表述有点问题,没有明白你是用cDNA做模板进行pcr还是直接检测反转录的情况,cDNA质量(很少有人会这么做)
不管怎么样,您右边都是没有产物的。实验没有成功!
就是用RNA进行逆转录的啊,那如何检测是否成功呢
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2013-05-01 22:11:00
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andywang6137
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2013-05-02 12:05:17
为什么不把图像正放过来呢?检测也是直接电泳检测RNA,几乎没有人检测反转录后的cDNA,反转录试剂还是比较贵的。右边2个孔只有引物二聚体,没有PCR产物。
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6楼
2013-05-02 08:36:54
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renzhiq
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foxhuli(gyesang代发): 金币+1, 鼓励回帖应助!
2013-05-02 12:05:30
检测很简单啊。你用通用引物,以cDNA为模板进行扩增,再跑胶就可以了……
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7楼
2013-05-02 09:23:20
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guaiyaya
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你的CDNA片段是多长?
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2013-05-02 09:25:44
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foxhuli
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dafeizizhu
at 2013-05-02 10:03:14
首先,绝大多数人看电泳图都是点样孔在上边,偶尔有人这样放的。这就是另类。其次,要让人看明白电泳图,必须使用图片处理软件将每个电泳孔都标注清楚了。下面我来说说关于cDNA问题:一般情况下,要检验RNA提取结果 ...
谢谢哦,新手上路,太容易开到河里去了。受教
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12楼
2013-05-02 20:55:33
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foxhuli
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nmhsd
at 2013-05-02 11:04:51
没有哪位大神会告诉你能从cDNA电泳看出来是否RT成功。继续做下面的吧!
恩,继续重复
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13楼
2013-05-02 20:57:19
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dafeizizhu
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dafeizizhu
at 2013-05-02 10:03:14
首先,绝大多数人看电泳图都是点样孔在上边,偶尔有人这样放的。这就是另类。其次,要让人看明白电泳图,必须使用图片处理软件将每个电泳孔都标注清楚了。下面我来说说关于cDNA问题:一般情况下,要检验RNA提取结果 ...
希望我们共同进步
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14楼
2013-05-07 15:40:48
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foxhuli
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Originally posted by
dafeizizhu
at 2013-05-02 10:03:14
首先,绝大多数人看电泳图都是点样孔在上边,偶尔有人这样放的。这就是另类。其次,要让人看明白电泳图,必须使用图片处理软件将每个电泳孔都标注清楚了。下面我来说说关于cDNA问题:一般情况下,要检验RNA提取结果 ...
打扰,我还想问一下,是不是只要是同一个物种,GSTπ基因序列是一样的呢? 嘿嘿 ,外行了
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15楼
2013-05-11 18:39:48
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yingying1588
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2013-05-01 22:27
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